RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.06□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.06□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.05□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 J3QL48 77 aa4.05□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 C7orf33Q8WU49 177 aa4.05□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 BPY2O14599 106 aa4.05□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 PRR4Q16378 134 aa4.05□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.05□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.05□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.04□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.04□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 Q8N3U1 123 aa4.04□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 EPM2AB3EWF7 344 aa4.04□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.04□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 Q8IZM0 81 aa4.04□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 Q8N9L7 120 aa4.04□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.03□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 UBE2BP63146 152 aa4.03□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.03□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.03□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 CUBNO60494 3623 aa4.03□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.03□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.03□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 PDE6GP18545 87 aa4.03□□□□□ -1.76
SHQ1-205ENST00000468371 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.02□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 Q6ZVQ6 151 aa4.02□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 A0A087WTM6 91 aa4.02□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.02□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 FAM104AQ969W3 186 aa4.02□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 RTL8CO15255 209 aa4.02□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.01□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.01□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 LINC00575Q6W349 94 aa4□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 SMIM26A0A096LP01 95 aa4□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 C10orf25Q5T742 122 aa3.99□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 COX17Q14061 63 aa3.99□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa3.99□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.99□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.99□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 Q6ZR54 194 aa3.98□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.98□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 A0A096LNI7 61 aa3.98□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 C2orf48Q96LS8 159 aa3.98□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.98□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 SYCNQ0VAF6 134 aa3.98□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 H3BQ85 93 aa3.98□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.98□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 NDUFC1O43677 76 aa3.97□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.97□□□□□ -1.77
SHQ1-205ENST00000468371 A0A1B0GUV1 79 aa3.96□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 C1orf195Q5TG92 126 aa3.96□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 Q6ZQT0 140 aa3.96□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 MP68P56378 58 aa3.96□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.96□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.96□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 COL7A1Q02388 2944 aa3.96□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 M0R378 163 aa3.96□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 PRYO14603 147 aa3.95□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 PSPHP1O15172 72 aa3.95□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.95□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 V9GYY9 64 aa3.95□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 LINC01600Q96MT4 127 aa3.95□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 NDUFS5O43920 106 aa3.95□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 PRO0628Q9UI54 55 aa3.94□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 H0Y9J4 135 aa3.93□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 Q6ZRU5 148 aa3.93□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 LINC00528Q8N1L1 170 aa3.93□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.93□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 CXCL6P80162 114 aa3.92□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.92□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 C22orf24Q9Y442 160 aa3.92□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP10-2P60368 255 aa3.92□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 C1orf137Q5JT78 98 aa3.92□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 H7BZZ5 65 aa3.92□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 CDK2AP2O75956 126 aa3.92□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 SMIM29Q86T20 159 aa3.92□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 ANK2Q01484 3957 aa3.91□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 Q5VSD8 79 aa3.91□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 KIAA0087Q14695 138 aa3.91□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.9□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 LINC00208Q96KT6 92 aa3.9□□□□□ -1.78
SHQ1-205ENST00000468371 OXTP01178 125 aa3.9□□□□□ -1.79
SHQ1-205ENST00000468371 UBE2AP49459 152 aa3.9□□□□□ -1.79
SHQ1-205ENST00000468371 REG3GQ6UW15 175 aa3.9□□□□□ -1.79
SHQ1-205ENST00000468371 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.89□□□□□ -1.79
SHQ1-205ENST00000468371 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.89□□□□□ -1.79
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP10-1P60331 282 aa3.88□□□□□ -1.79
SHQ1-205ENST00000468371 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.88□□□□□ -1.79
SHQ1-205ENST00000468371 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms