RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 CCDC179H3BU77 68 aa5.68□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.68□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.68□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.68□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.68□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 TRAV10A0A0B4J240 114 aa5.67□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 VPREB1P12018 145 aa5.67□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 ESRGQ1W209 222 aa5.67□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZQT0 140 aa5.67□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 CRYGAP11844 174 aa5.66□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 SYCNQ0VAF6 134 aa5.66□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.66□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZTC4 211 aa5.66□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.66□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 SERP2Q8N6R1 65 aa5.66□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.66□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.65□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 CXCL6P80162 114 aa5.65□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZQY7 126 aa5.65□□□□□ -1.5
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZRU5 148 aa5.64□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 C15orf56Q8N910 161 aa5.64□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 Q8NDZ9 215 aa5.64□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.63□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.63□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.63□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.63□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 USP17L23D6RBM5 183 aa5.63□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.63□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.63□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.63□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.63□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 NOTCH1P46531 2555 aa5.62□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.62□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 RETNQ9HD89 108 aa5.62□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.62□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.62□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa5.61□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 UPK3BQ9BT76 320 aa5.61□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 PRYO14603 147 aa5.6□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.6□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 FBN3Q75N90 2809 aa5.59□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.59□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 TMEM258P61165 79 aa5.59□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 TNP2Q05952 138 aa5.59□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZRP5 223 aa5.59□□□□□ -1.51
ACTB-208ENST00000464611 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa5.59□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZVQ6 151 aa5.58□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.57□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 HAMPP81172 84 aa5.57□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.56□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.55□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.55□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.55□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 SPRR1AP35321 89 aa5.55□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 C14orf177Q52M58 125 aa5.55□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 C7orf33Q8WU49 177 aa5.55□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.55□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.55□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 A0A087WVE0 104 aa5.54□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 NREPQ16612 68 aa5.54□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZRX8 168 aa5.54□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 J3KT08 172 aa5.53□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 NDUFC1O43677 76 aa5.53□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 ERC2-IT1O76042 136 aa5.53□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.53□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.53□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.53□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.53□□□□□ -1.52
ACTB-208ENST00000464611 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.52□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 NUPR2A6NF83 97 aa5.51□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 KLKP1Q107X0 134 aa5.5□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.5□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 Q8N377 158 aa5.5□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 SVIPQ8NHG7 77 aa5.5□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 REG3GQ6UW15 175 aa5.49□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.48□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 C16orf90A8MZG2 172 aa5.48□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 BPY2O14599 106 aa5.48□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 SPRR4Q96PI1 79 aa5.48□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 F8WEM9 126 aa5.47□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 H0Y9J4 135 aa5.47□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 C3orf84H3BNL1 204 aa5.47□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 M0R2N4 97 aa5.47□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 DPH3Q96FX2 82 aa5.47□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.47□□□□□ -1.53
ACTB-208ENST00000464611 C1orf137Q5JT78 98 aa5.46□□□□□ -1.54
ACTB-208ENST00000464611 Q8NBF4 154 aa5.46□□□□□ -1.54
ACTB-208ENST00000464611 PSCAO43653 123 aa5.45□□□□□ -1.54
ACTB-208ENST00000464611 UBE2BP63146 152 aa5.45□□□□□ -1.54
ACTB-208ENST00000464611 C20orf197Q8N268 126 aa5.45□□□□□ -1.54
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