RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	LELP1	Q5T871	98 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	TSC2	P49815	1807 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	NDUFA4	O00483	81 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	SPINK4	O60575	86 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454		U3KQA8	63 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	AKAP6	Q13023	2319 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	SPINK1	P00995	79 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF292	O60281	2723 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	TNXB	P22105	4242 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	VWF	P04275	2813 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	KMT2D	O14686	5537 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	C3orf79	P0CE67	100 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	APLN	Q9ULZ1	77 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CLK1-208	ENST00000464454	BSN	Q9UPA5	3926 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	NHS	Q6T4R5	1651 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	MADD	Q8WXG6	1647 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	NDUFA3	O95167	84 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	ATXN8	Q156A1	80 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	ITSN1	Q15811	1721 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	HFM1	A2PYH4	1435 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454		H0YAA0	97 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	KLK9	Q2XQG4	91 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	NES	P48681	1621 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	PLXNC1	O60486	1568 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	REV3L	O60673	3130 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	PRM1	P04553	51 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	ENHO	Q6UWT2	76 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	CHD6	Q8TD26	2715 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	DEPDC5	O75140	1603 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	LPA	P08519	4548 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454		H3BVH4	76 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	SPRR2D	P22532	72 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	CRIP1	P50238	77 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	RICTOR	Q6R327	1708 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	PRO3102	Q9H379	93 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	UBL5	Q9BZL1	73 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	ABCC6	O95255	1503 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	MYCBP2	O75592	4640 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CLK1-208	ENST00000464454	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CLK1-208	ENST00000464454	LINC00158	P58513	81 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CLK1-208	ENST00000464454	KMT2A	Q03164	3969 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CLK1-208	ENST00000464454	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
CLK1-208	ENST00000464454	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
CLK1-208	ENST00000464454	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		0.14	□□□□□ -2.39
CLK1-208	ENST00000464454	ATR	Q13535	2644 aa		0.14	□□□□□ -2.39
CLK1-208	ENST00000464454	TJP1	Q07157	1748 aa		0.14	□□□□□ -2.39
CLK1-208	ENST00000464454	LINC01549	A6NIU2	74 aa		0.14	□□□□□ -2.39
CLK1-208	ENST00000464454	S100Z	Q8WXG8	99 aa		0.14	□□□□□ -2.39
CLK1-208	ENST00000464454	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
CLK1-208	ENST00000464454	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		0.13	□□□□□ -2.39
CLK1-208	ENST00000464454	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		0.13	□□□□□ -2.39
CLK1-208	ENST00000464454		M0R2T5	61 aa		0.13	□□□□□ -2.39
CLK1-208	ENST00000464454	GLI2	P10070	1586 aa		0.13	□□□□□ -2.39
CLK1-208	ENST00000464454	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		0.13	□□□□□ -2.39
CLK1-208	ENST00000464454	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		0.13	□□□□□ -2.39
CLK1-208	ENST00000464454	CACNA1A	O00555	2505 aa		0.13	□□□□□ -2.39

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