RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462351.5

PTPRN-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRN, Length 5,099 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-211ENST00000462351 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRN-211ENST00000462351 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRN-211ENST00000462351 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRN-211ENST00000462351 EPM2AB3EWF7 344 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRN-211ENST00000462351 IGLV6-57P01721 117 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRN-211ENST00000462351 PRR15Q8IV56 129 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRN-211ENST00000462351 LAMA1P25391 3075 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRN-211ENST00000462351 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRN-211ENST00000462351 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRN-211ENST00000462351 APLNQ9ULZ1 77 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRN-211ENST00000462351 VCANP13611 3396 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRN-211ENST00000462351 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRN-211ENST00000462351 H3BNG1 76 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRN-211ENST00000462351 Q96NJ1 140 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRN-211ENST00000462351 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRN-211ENST00000462351 Q6ZRP5 223 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRN-211ENST00000462351 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRN-211ENST00000462351 C16orf90A8MZG2 172 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRN-211ENST00000462351 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRN-211ENST00000462351 LUZP6Q538Z0 58 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRN-211ENST00000462351 C8orf17Q9NRJ1 99 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRN-211ENST00000462351 KLK9Q2XQG4 91 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRN-211ENST00000462351 CFAP54Q96N23 3096 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRN-211ENST00000462351 REV3LO60673 3130 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRN-211ENST00000462351 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRN-211ENST00000462351 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRN-211ENST00000462351 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRN-211ENST00000462351 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
PTPRN-211ENST00000462351 IGFL1Q6UW32 110 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRN-211ENST00000462351 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRN-211ENST00000462351 LINC01554Q52M75 96 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRN-211ENST00000462351 Q1T7F1 81 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRN-211ENST00000462351 H3BS24 57 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRN-211ENST00000462351 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRN-211ENST00000462351 A0A1B0GVX0 72 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRN-211ENST00000462351 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRN-211ENST00000462351 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRN-211ENST00000462351 Q8N377 158 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRN-211ENST00000462351 CHTF8P0CG12 524 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRN-211ENST00000462351 FAM104AQ969W3 186 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRN-211ENST00000462351 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRN-211ENST00000462351 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRN-211ENST00000462351 DSCR10P59022 87 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRN-211ENST00000462351 EYSQ5T1H1 3165 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRN-211ENST00000462351 FAM168BA1KXE4 195 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRN-211ENST00000462351 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRN-211ENST00000462351 MGAQ8IWI9 3026 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRN-211ENST00000462351 RTL8CO15255 209 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRN-211ENST00000462351 SPEGQ15772 3267 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRN-211ENST00000462351 USP24Q9UPU5 2620 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRN-211ENST00000462351 A0A096LNT2 108 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRN-211ENST00000462351 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRN-211ENST00000462351 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRN-211ENST00000462351 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRN-211ENST00000462351 ZNF292O60281 2723 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRN-211ENST00000462351 OCR1Q9BZK8 76 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-211ENST00000462351 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-211ENST00000462351 DNAH10OSP0CZ25 163 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-211ENST00000462351 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-211ENST00000462351 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-211ENST00000462351 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-211ENST00000462351 Q8NAQ8 132 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRN-211ENST00000462351 A0A1W2PNM2 257 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRN-211ENST00000462351 A0A0D9SG42 100 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRN-211ENST00000462351 Q75L30 129 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRN-211ENST00000462351 C15orf56Q8N910 161 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRN-211ENST00000462351 A0A0G2JQZ4 141 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRN-211ENST00000462351 A0A1W2PNN7 141 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRN-211ENST00000462351 PRR34Q9NV39 138 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRN-211ENST00000462351 Q5XG85 94 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRN-211ENST00000462351 A0A0A0MQY5 61 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRN-211ENST00000462351 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRN-211ENST00000462351 DSPP15924 2871 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PTPRN-211ENST00000462351 AKAP13Q12802 2813 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRN-211ENST00000462351 ZNF575Q86XF7 245 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRN-211ENST00000462351 ZNF861PO60384 105 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRN-211ENST00000462351 FRYLO94915 3013 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRN-211ENST00000462351 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRN-211ENST00000462351 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRN-211ENST00000462351 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRN-211ENST00000462351 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRN-211ENST00000462351 PRAC1Q96KF2 57 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRN-211ENST00000462351 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
PTPRN-211ENST00000462351 Q8N1X5 172 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRN-211ENST00000462351 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRN-211ENST00000462351 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRN-211ENST00000462351 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRN-211ENST00000462351 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
PTPRN-211ENST00000462351 A0A1B0GU33 70 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRN-211ENST00000462351 COL6A3P12111 3177 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRN-211ENST00000462351 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRN-211ENST00000462351 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRN-211ENST00000462351 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRN-211ENST00000462351 MGAM2Q2M2H8 2515 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRN-211ENST00000462351 USP34Q70CQ2 3546 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRN-211ENST00000462351 DMAC1Q96GE9 116 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP10-3P60369 221 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRN-211ENST00000462351 FREM2Q5SZK8 3169 aa9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.4 ms