RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 NDUFC1O43677 76 aa-1.38□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-1.38□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 C2orf88Q9BSF0 95 aa-1.38□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 AP4S1Q9Y587 144 aa-1.38□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-1.38□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 TEX15Q9BXT5 2789 aa-1.39□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 C4AP0C0L4 1744 aa-1.39□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 C4BP0C0L5 1744 aa-1.39□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 EFCAB10A6NFE3 127 aa-1.39□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 MT-ATP8P03928 68 aa-1.39□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-1.4□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 D6R8Y8 96 aa-1.4□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 LEPROTL1O95214 131 aa-1.4□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 DEFA5Q01523 94 aa-1.4□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 NMSQ5H8A3 153 aa-1.4□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 MUSTN1Q8IVN3 82 aa-1.4□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-1.4□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 MAGI2Q86UL8 1455 aa-1.4□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-1.4□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-1.4□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-1.4□□□□□ -2.636e-19■■■■■ 76.2
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TTC3-211ENST00000460328 PREX1Q8TCU6 1659 aa-1.41□□□□□ -2.63
TTC3-211ENST00000460328 F8WEM9 126 aa-1.41□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 FAM135AQ9P2D6 1515 aa-1.41□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 QSER1Q2KHR3 1735 aa-1.42□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa-1.42□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 C9orf92A6NGG3 77 aa-1.42□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 MPC2O95563 127 aa-1.42□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 COX7BP24311 80 aa-1.42□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP-1.42□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 ETDBQ3ZM63 59 aa-1.42□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-1.42□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 SCN11AQ9UI33 1791 aa-1.43□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-1.43□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 SERP2Q8N6R1 65 aa-1.43□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-1.43□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 UBR3Q6ZT12 1888 aa-1.43□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 LAMA3Q16787 3333 aa-1.44□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-1.44□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 ABCC2Q92887 1545 aa-1.44□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 C20orf202A1L168 122 aa-1.44□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 ZZEF1O43149 2961 aa-1.44□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-1.44□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 DNAH11Q96DT5 4516 aa-1.44□□□□□ -2.64
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TTC3-211ENST00000460328 S100A10P60903 97 aa-1.45□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 ITPR2Q14571 2701 aa-1.45□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 KALRNO60229 2985 aa-1.45□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-1.46□□□□□ -2.64
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TTC3-211ENST00000460328 FAUP35544 74 aaKnown RBP-1.46□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-1.46□□□□□ -2.64
TTC3-211ENST00000460328 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-1.46□□□□□ -2.64
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TTC3-211ENST00000460328 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-1.48□□□□□ -2.65
TTC3-211ENST00000460328 S4R3F8 94 aa-1.48□□□□□ -2.65
TTC3-211ENST00000460328 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-1.49□□□□□ -2.65
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TTC3-211ENST00000460328 GAFA1Q96PS6 74 aa-1.49□□□□□ -2.65
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TTC3-211ENST00000460328 RGPD5Q99666 1765 aa-1.49□□□□□ -2.65
TTC3-211ENST00000460328 ACACAQ13085 2346 aa-1.5□□□□□ -2.65
TTC3-211ENST00000460328 ALKQ9UM73 1620 aa-1.5□□□□□ -2.65
TTC3-211ENST00000460328 MAP3K1Q13233 1512 aa-1.5□□□□□ -2.65
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TTC3-211ENST00000460328 TRIOO75962 3097 aa-1.51□□□□□ -2.65
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TTC3-211ENST00000460328 LRRK2Q5S007 2527 aa-1.52□□□□□ -2.65
TTC3-211ENST00000460328 LINC00158P58513 81 aa-1.52□□□□□ -2.65
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TTC3-211ENST00000460328 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
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TTC3-211ENST00000460328 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 PLXNC1O60486 1568 aa-1.55□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-1.56□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 K7EP34 96 aa-1.56□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 PRLHP81277 87 aa-1.56□□□□□ -2.66
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