RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 A8MUU9 505 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-209ENST00000442510 SPRR4Q96PI1 79 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-209ENST00000442510 PLA2G2CQ5R387 149 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-209ENST00000442510 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-209ENST00000442510 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF575Q86XF7 245 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-209ENST00000442510 DEFB4AO15263 64 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GVX0 72 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-209ENST00000442510 LY6G6CO95867 125 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-209ENST00000442510 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF861PO60384 105 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-209ENST00000442510 HIVEP2P31629 2446 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-209ENST00000442510 DEFB135Q30KP9 77 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-209ENST00000442510 IGLV1-40P01703 118 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-209ENST00000442510 C14orf177Q52M58 125 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-209ENST00000442510 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRC-209ENST00000442510 ABCA2Q9BZC7 2435 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0G2JQZ4 141 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PNN7 141 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-209ENST00000442510 Q6YL49 198 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-209ENST00000442510 NOTCH2Q04721 2471 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-209ENST00000442510 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-209ENST00000442510 NAV2Q8IVL1 2488 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-209ENST00000442510 C15orf56Q8N910 161 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-209ENST00000442510 MYO9AB2RTY4 2548 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-209ENST00000442510 Q5W150 140 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-209ENST00000442510 LRRK2Q5S007 2527 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-209ENST00000442510 PTPN13Q12923 2485 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-209ENST00000442510 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
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PTPRC-209ENST00000442510 COL4A6Q14031 1691 aa3.47□□□□□ -1.85
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PTPRC-209ENST00000442510 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
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PTPRC-209ENST00000442510 POLQO75417 2590 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-209ENST00000442510 PKD1L2Q7Z442 2459 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRC-209ENST00000442510 U3KQA8 63 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-209ENST00000442510 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-209ENST00000442510 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-209ENST00000442510 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-209ENST00000442510 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-209ENST00000442510 MYO18BQ8IUG5 2567 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-209ENST00000442510 TLN2Q9Y4G6 2542 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-209ENST00000442510 Q96NJ1 140 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-209ENST00000442510 IGF2RP11717 2491 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-209ENST00000442510 PANO1I0J062 215 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-209ENST00000442510 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-209ENST00000442510 ACANP16112 2415 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-209ENST00000442510 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0C4DFX4 3053 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-209ENST00000442510 ABCA12Q86UK0 2595 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-209ENST00000442510 MUC6Q6W4X9 2439 aa3.39□□□□□ -1.87
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PTPRC-209ENST00000442510 J3QKU1 62 aa3.38□□□□□ -1.87
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PTPRC-209ENST00000442510 NCOR2Q9Y618 2525 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRC-209ENST00000442510 A0A087WTM6 91 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-209ENST00000442510 SPRR1AP35321 89 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-209ENST00000442510 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
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PTPRC-209ENST00000442510 COL4A2P08572 1712 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-209ENST00000442510 FASNP49327 2511 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-209ENST00000442510 CENPFP49454 3210 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-209ENST00000442510 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-209ENST00000442510 MTORP42345 2549 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-209ENST00000442510 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-209ENST00000442510 SPTBN4Q9H254 2564 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-209ENST00000442510 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.26□□□□□ -1.89
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