RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436139.6

RASGEF1B-203, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RASGEF1B, Length 6,323 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-203ENST00000436139 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa5.53□□□□□ -1.52
RASGEF1B-203ENST00000436139 TLN2Q9Y4G6 2542 aa5.53□□□□□ -1.52
RASGEF1B-203ENST00000436139 LCA10Q71F78 164 aa5.53□□□□□ -1.52
RASGEF1B-203ENST00000436139 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.52□□□□□ -1.53
RASGEF1B-203ENST00000436139 F8P00451 2351 aa5.52□□□□□ -1.53
RASGEF1B-203ENST00000436139 FN1P02751 2386 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RASGEF1B-203ENST00000436139 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.52□□□□□ -1.53
RASGEF1B-203ENST00000436139 J3QL48 77 aa5.52□□□□□ -1.53
RASGEF1B-203ENST00000436139 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RASGEF1B-203ENST00000436139 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.51□□□□□ -1.53
RASGEF1B-203ENST00000436139 ZNF861PO60384 105 aa5.51□□□□□ -1.53
RASGEF1B-203ENST00000436139 KRTAP10-11P60412 298 aa5.5□□□□□ -1.53
RASGEF1B-203ENST00000436139 C9orf92A6NGG3 77 aa5.5□□□□□ -1.53
RASGEF1B-203ENST00000436139 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RASGEF1B-203ENST00000436139 POLQO75417 2590 aa5.49□□□□□ -1.53
RASGEF1B-203ENST00000436139 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.49□□□□□ -1.53
RASGEF1B-203ENST00000436139 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.49□□□□□ -1.53
RASGEF1B-203ENST00000436139 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.49□□□□□ -1.53
RASGEF1B-203ENST00000436139 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RASGEF1B-203ENST00000436139 A0A1W2PNM2 257 aa5.47□□□□□ -1.53
RASGEF1B-203ENST00000436139 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.47□□□□□ -1.53
RASGEF1B-203ENST00000436139 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa5.47□□□□□ -1.53
RASGEF1B-203ENST00000436139 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 MTORP42345 2549 aa5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 K7EIL1 84 aa5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 Q1T7F1 81 aa5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 FAM104AQ969W3 186 aa5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 KRTAP10-3P60369 221 aa5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 SPRR4Q96PI1 79 aa5.44□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 A0A087WTM6 91 aa5.43□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 MUC4Q99102 2169 aa5.43□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 IGLV7-43P04211 117 aa5.43□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.43□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 OCR1Q9BZK8 76 aa5.42□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.42□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 HECTD1Q9ULT8 2610 aa5.41□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 CASC10Q5T4H9 136 aa5.41□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.41□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 A0A0D9SG42 100 aa5.41□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 Q8N1X5 172 aa5.41□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.41□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 A0A096LNT2 108 aa5.41□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.41□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 ACANP16112 2415 aa5.41□□□□□ -1.54
RASGEF1B-203ENST00000436139 WIPF1O43516 503 aa5.4□□□□□ -1.55
RASGEF1B-203ENST00000436139 CENPFP49454 3210 aa5.38□□□□□ -1.55
RASGEF1B-203ENST00000436139 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.38□□□□□ -1.55
RASGEF1B-203ENST00000436139 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.37□□□□□ -1.55
RASGEF1B-203ENST00000436139 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RASGEF1B-203ENST00000436139 ZNF575Q86XF7 245 aa5.37□□□□□ -1.55
RASGEF1B-203ENST00000436139 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RASGEF1B-203ENST00000436139 Q75L30 129 aa5.37□□□□□ -1.55
RASGEF1B-203ENST00000436139 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.36□□□□□ -1.55
RASGEF1B-203ENST00000436139 LINC01554Q52M75 96 aa5.35□□□□□ -1.55
RASGEF1B-203ENST00000436139 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RASGEF1B-203ENST00000436139 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.35□□□□□ -1.55
RASGEF1B-203ENST00000436139 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.35□□□□□ -1.55
RASGEF1B-203ENST00000436139 Q5XG85 94 aa5.35□□□□□ -1.55
RASGEF1B-203ENST00000436139 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.34□□□□□ -1.55
RASGEF1B-203ENST00000436139 HRES1P13985 223 aa5.31□□□□□ -1.56
RASGEF1B-203ENST00000436139 LUZP6Q538Z0 58 aa5.3□□□□□ -1.56
RASGEF1B-203ENST00000436139 A0A1B0GU33 70 aa5.3□□□□□ -1.56
RASGEF1B-203ENST00000436139 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.3□□□□□ -1.56
RASGEF1B-203ENST00000436139 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.29□□□□□ -1.56
RASGEF1B-203ENST00000436139 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RASGEF1B-203ENST00000436139 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
RASGEF1B-203ENST00000436139 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
RASGEF1B-203ENST00000436139 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.27□□□□□ -1.57
RASGEF1B-203ENST00000436139 Q5VV11 94 aa5.25□□□□□ -1.57
RASGEF1B-203ENST00000436139 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
RASGEF1B-203ENST00000436139 Q8NDZ9 215 aa5.24□□□□□ -1.57
RASGEF1B-203ENST00000436139 PRAC1Q96KF2 57 aa5.24□□□□□ -1.57
RASGEF1B-203ENST00000436139 LINC00483Q53H64 154 aa5.22□□□□□ -1.57
RASGEF1B-203ENST00000436139 Q6ZSA8 131 aa5.21□□□□□ -1.57
RASGEF1B-203ENST00000436139 DMAC1Q96GE9 116 aa5.21□□□□□ -1.57
RASGEF1B-203ENST00000436139 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
RASGEF1B-203ENST00000436139 TNP2Q05952 138 aa5.2□□□□□ -1.58
RASGEF1B-203ENST00000436139 SPRR1AP35321 89 aa5.2□□□□□ -1.58
RASGEF1B-203ENST00000436139 SPINK7P58062 85 aa5.2□□□□□ -1.58
RASGEF1B-203ENST00000436139 H3BS24 57 aa5.19□□□□□ -1.58
RASGEF1B-203ENST00000436139 CSAG1Q6PB30 78 aa5.19□□□□□ -1.58
RASGEF1B-203ENST00000436139 Q5W150 140 aa5.19□□□□□ -1.58
RASGEF1B-203ENST00000436139 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.19□□□□□ -1.58
RASGEF1B-203ENST00000436139 S4R3F8 94 aa5.19□□□□□ -1.58
RASGEF1B-203ENST00000436139 CR1P17927 2039 aa5.18□□□□□ -1.58
RASGEF1B-203ENST00000436139 MGAM2Q2M2H8 2515 aa5.18□□□□□ -1.58
RASGEF1B-203ENST00000436139 UTRNP46939 3433 aa5.18□□□□□ -1.58
RASGEF1B-203ENST00000436139 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.17□□□□□ -1.58
RASGEF1B-203ENST00000436139 CEP350Q5VT06 3117 aa5.17□□□□□ -1.58
RASGEF1B-203ENST00000436139 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.17□□□□□ -1.58
RASGEF1B-203ENST00000436139 OXTP01178 125 aa5.16□□□□□ -1.58
RASGEF1B-203ENST00000436139 SPRR1BP22528 89 aa5.14□□□□□ -1.59
RASGEF1B-203ENST00000436139 BAHCC1Q9P281 2608 aa5.14□□□□□ -1.59
RASGEF1B-203ENST00000436139 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1B-203ENST00000436139 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1B-203ENST00000436139 ITPR3Q14573 2671 aa5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms