RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa10.52□□□□□ -0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 C9orf118A6NHY6 69 aa10.52□□□□□ -0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 COX6CP09669 75 aa10.52□□□□□ -0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 VAMP3Q15836 100 aa10.52□□□□□ -0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIAP1O43715 76 aa10.5□□□□□ -0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa10.5□□□□□ -0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa10.49□□□□□ -0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 H3BUT2 72 aa10.49□□□□□ -0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 BCE1O60756 84 aa10.49□□□□□ -0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAH8Q96JB1 4490 aa10.49□□□□□ -0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 H0YGX0 51 aa10.48□□□□□ -0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 COX7BP24311 80 aa10.47□□□□□ -0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 LYRM7Q5U5X0 104 aa10.47□□□□□ -0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRP1BQ9NZR2 4599 aa10.47□□□□□ -0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 B5MCH6 92 aa10.46□□□□□ -0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCGB1C2P0DMR2 95 aa10.46□□□□□ -0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa10.46□□□□□ -0.74
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TOP3BP1-201ENST00000420768 C1orf137Q5JT78 98 aa10.45□□□□□ -0.74
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TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PPM0 123 aa10.44□□□□□ -0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00528Q8N1L1 170 aa10.44□□□□□ -0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBE2AP49459 152 aa10.43□□□□□ -0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 INAFM2P0DMQ5 153 aa10.42□□□□□ -0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 FABP2P12104 132 aa10.42□□□□□ -0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNCGO76070 127 aa10.41□□□□□ -0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa10.41□□□□□ -0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC25A20O43772 301 aa10.4□□□□□ -0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGLV7-43P04211 117 aa10.4□□□□□ -0.74
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TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00575Q6W349 94 aa10.4□□□□□ -0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa10.4□□□□□ -0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa10.39□□□□□ -0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1B0GX51 115 aa10.39□□□□□ -0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLEC2BQ92478 149 aa10.39□□□□□ -0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF861PO60384 105 aa10.38□□□□□ -0.75
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TOP3BP1-201ENST00000420768 Q9BRP9 147 aa10.38□□□□□ -0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 hADV29S1A0JD25 119 aa10.37□□□□□ -0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM229AH3BQW9 127 aa10.37□□□□□ -0.75
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TCL1BO95988 128 aa10.36□□□□□ -0.75
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TOP3BP1-201ENST00000420768 HIGD2AQ9BW72 106 aa10.36□□□□□ -0.75
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TOP3BP1-201ENST00000420768 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 K7EP34 96 aa10.3□□□□□ -0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERC2-IT1O76042 136 aa10.3□□□□□ -0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q5VSD8 79 aa10.29□□□□□ -0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZQY7 126 aa10.29□□□□□ -0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa10.29□□□□□ -0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 OCIAD2Q56VL3 154 aa10.28□□□□□ -0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q8N1X5 172 aa10.28□□□□□ -0.76
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TOP3BP1-201ENST00000420768 GHRHP01286 108 aa10.27□□□□□ -0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPINK6Q6UWN8 80 aa10.27□□□□□ -0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1B0GV90 55 aa10.26□□□□□ -0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 H3BQ85 93 aa10.26□□□□□ -0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 ORMDL1Q9P0S3 153 aa10.26□□□□□ -0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.24□□□□□ -0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa10.24□□□□□ -0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPDPFLQ8WWR9 84 aa10.24□□□□□ -0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPRR4Q96PI1 79 aa10.23□□□□□ -0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa10.22□□□□□ -0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 C9JAW5 83 aa10.22□□□□□ -0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFB105AQ8NG35 78 aa10.22□□□□□ -0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSPG2P98160 4391 aa10.21□□□□□ -0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa10.21□□□□□ -0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPRR1BP22528 89 aa10.2□□□□□ -0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 GAGE2AQ6NT46 116 aa10.2□□□□□ -0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 BAALC-AS2P0C853 105 aa10.19□□□□□ -0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00483Q53H64 154 aa10.19□□□□□ -0.78
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TOP3BP1-201ENST00000420768 UBE2V1Q13404 147 aa10.18□□□□□ -0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa10.18□□□□□ -0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa10.17□□□□□ -0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 RYR1P21817 5038 aa10.15□□□□□ -0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 F8W1H4 67 aa10.15□□□□□ -0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD29Q8N6D5 301 aa10.15□□□□□ -0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTURNQ8N3F0 131 aa10.14□□□□□ -0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC01600Q96MT4 127 aa10.14□□□□□ -0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRO0461Q9UI25 63 aa10.14□□□□□ -0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIAA1109Q2LD37 5005 aa10.14□□□□□ -0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa10.14□□□□□ -0.79
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