RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 SYCNQ0VAF6 134 aa4.31□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 SS18Q15532 418 aa4.31□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 OSTCQ9NRP0 149 aa4.31□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP10-8P60410 259 aa4.3□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.3□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.3□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 V9GYV3 84 aa4.3□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.29□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 H3BUT2 72 aa4.29□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 Q6ZUT4 128 aa4.29□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 NUP35Q8NFH5 326 aa4.29□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 A0A1W2PNN7 141 aa4.29□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 COX7A2LO14548 114 aa4.29□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.28□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 APOMO95445 188 aa4.28□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 PPP1R17O96001 155 aa4.28□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 FCER1GP30273 86 aa4.28□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.28□□□□□ -1.72
CTXN3-201ENST00000379445 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa4.27□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 SMIM13P0DJ93 91 aa4.27□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 COX8AP10176 69 aa4.27□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.27□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 C5orf38Q86SI9 138 aa4.27□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 ATOH7Q8N100 152 aa4.27□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 FAM104AQ969W3 186 aa4.27□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.27□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 LPAP08519 4548 aa4.27□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 SPAG11BQ08648 103 aa4.26□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 C20orf78Q9BR46 151 aa4.26□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.26□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.26□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 Q6Q795 121 aa4.26□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.26□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.26□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.25□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.25□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 A0A1B0GX51 115 aa4.24□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 J3KT08 172 aa4.24□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 MT-ATP8P03928 68 aa4.24□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 CKS2P33552 79 aa4.24□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 CXCL5P42830 114 aa4.24□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.24□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 D6R8Y8 96 aa4.23□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 H3BMG7 143 aa4.23□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 NPYP01303 97 aa4.23□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.23□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 IFITM1P13164 125 aa4.23□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 NMUP48645 174 aa4.23□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 UBE2AP49459 152 aa4.23□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.23□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.23□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.23□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.23□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 LITAFQ99732 161 aa4.23□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 HBBP68871 147 aa4.22□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.22□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 C1orf137Q5JT78 98 aa4.22□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.22□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.22□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 FAM168BA1KXE4 195 aa4.22□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.22□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 CCDC179H3BU77 68 aa4.22□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 NDUFA1O15239 70 aa4.22□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 IGLV7-43P04211 117 aa4.22□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 ETDBQ3ZM63 59 aa4.22□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.22□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 Q8N377 158 aa4.22□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.22□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.22□□□□□ -1.73
CTXN3-201ENST00000379445 LINC01545Q5VT33 79 aa4.21□□□□□ -1.74
CTXN3-201ENST00000379445 RAB37Q96AX2 223 aa4.21□□□□□ -1.74
CTXN3-201ENST00000379445 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.21□□□□□ -1.74
CTXN3-201ENST00000379445 PRELID3AQ96N28 172 aa4.21□□□□□ -1.74
CTXN3-201ENST00000379445 HIGD1BQ9P298 99 aa4.21□□□□□ -1.74
CTXN3-201ENST00000379445 LEPROTL1O95214 131 aa4.2□□□□□ -1.74
CTXN3-201ENST00000379445 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
CTXN3-201ENST00000379445 LINC00313P59037 77 aa4.2□□□□□ -1.74
CTXN3-201ENST00000379445 ORMDL3Q8N138 153 aa4.2□□□□□ -1.74
CTXN3-201ENST00000379445 DIRC1Q969H9 104 aa4.2□□□□□ -1.74
CTXN3-201ENST00000379445 SNCGO76070 127 aa4.19□□□□□ -1.74
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.19□□□□□ -1.74
CTXN3-201ENST00000379445 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.19□□□□□ -1.74
CTXN3-201ENST00000379445 PRO0461Q9UI25 63 aa4.19□□□□□ -1.74
CTXN3-201ENST00000379445 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.19□□□□□ -1.74
CTXN3-201ENST00000379445 C9JAW5 83 aa4.19□□□□□ -1.74
CTXN3-201ENST00000379445 UBE2D1P51668 147 aa4.19□□□□□ -1.74
CTXN3-201ENST00000379445 C2orf82Q6UX34 121 aa4.19□□□□□ -1.74
CTXN3-201ENST00000379445 TMEM141Q96I45 108 aa4.19□□□□□ -1.74
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