RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 LINC01600Q96MT4 127 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-204ENST00000373190 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-204ENST00000373190 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-204ENST00000373190 C16orf90A8MZG2 172 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-204ENST00000373190 KRTAP10-9P60411 292 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-204ENST00000373190 PRR15Q8IV56 129 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-204ENST00000373190 MDFIQ99750 246 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-204ENST00000373190 Q6ZRP5 223 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-204ENST00000373190 FAM229AH3BQW9 127 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-204ENST00000373190 TRANK1O15050 2925 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-204ENST00000373190 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-204ENST00000373190 NOTCH1P46531 2555 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-204ENST00000373190 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRT-204ENST00000373190 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRT-204ENST00000373190 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRT-204ENST00000373190 DSPP15924 2871 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRT-204ENST00000373190 TEX15Q9BXT5 2789 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRT-204ENST00000373190 KLK9Q2XQG4 91 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRT-204ENST00000373190 CHD7Q9P2D1 2997 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 LCA10Q71F78 164 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 CHTF8P0CG12 524 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 FAM168BA1KXE4 195 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 IGFL1Q6UW32 110 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 WIPF1O43516 503 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 Q8NAQ8 132 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 CRIPTQ9P021 101 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 Q96NJ1 140 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 FRYQ5TBA9 3013 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 Q1T7F1 81 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-204ENST00000373190 COL6A5A8TX70 2615 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRT-204ENST00000373190 RTL8CO15255 209 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRT-204ENST00000373190 Q8N377 158 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRT-204ENST00000373190 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRT-204ENST00000373190 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRT-204ENST00000373190 A0A1B0GVX0 72 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRT-204ENST00000373190 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRT-204ENST00000373190 VPS13AQ96RL7 3174 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRT-204ENST00000373190 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRT-204ENST00000373190 MGAQ8IWI9 3026 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRT-204ENST00000373190 STAB1Q9NY15 2570 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRT-204ENST00000373190 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRT-204ENST00000373190 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRT-204ENST00000373190 TRIOO75962 3097 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRT-204ENST00000373190 PRR34Q9NV39 138 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRT-204ENST00000373190 APLNQ9ULZ1 77 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-204ENST00000373190 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-204ENST00000373190 C15orf56Q8N910 161 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-204ENST00000373190 DSCR10P59022 87 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 NBEAQ8NFP9 2946 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 OCR1Q9BZK8 76 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 FREM2Q5SZK8 3169 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 KALRNO60229 2985 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 APCP25054 2843 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 STAB2Q8WWQ8 2551 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 Q75L30 129 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 A0A0G2JQZ4 141 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 A0A1W2PNN7 141 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 FAM104AQ969W3 186 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 Q5XG85 94 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 ITPR1Q14643 2758 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF292O60281 2723 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF861PO60384 105 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-204ENST00000373190 A0A1W2PNM2 257 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRT-204ENST00000373190 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-204ENST00000373190 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-204ENST00000373190 CHD9Q3L8U1 2897 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-204ENST00000373190 TACC2O95359 2948 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-204ENST00000373190 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-204ENST00000373190 LUZP6Q538Z0 58 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-204ENST00000373190 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-204ENST00000373190 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-204ENST00000373190 SPRR4Q96PI1 79 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-204ENST00000373190 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-204ENST00000373190 LRBAP50851 2863 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-204ENST00000373190 FRYLO94915 3013 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-204ENST00000373190 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-204ENST00000373190 LINC01554Q52M75 96 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-204ENST00000373190 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-204ENST00000373190 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-204ENST00000373190 A0A0D9SG42 100 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-204ENST00000373190 C9orf92A6NGG3 77 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-204ENST00000373190 ITPR2Q14571 2701 aa5.64□□□□□ -1.51
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