RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372906.2

TTPAL-203, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTPAL, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-203ENST00000372906 SPANXCQ9NY87 97 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPAL-203ENST00000372906 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPAL-203ENST00000372906 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPAL-203ENST00000372906 BCE1O60756 84 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPAL-203ENST00000372906 IFITM1P13164 125 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPAL-203ENST00000372906 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
TTPAL-203ENST00000372906 LITAFQ99732 161 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPAL-203ENST00000372906 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
TTPAL-203ENST00000372906 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
TTPAL-203ENST00000372906 ERG28Q9UKR5 140 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPAL-203ENST00000372906 COX17Q14061 63 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 LINC00167Q96N53 147 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 CDIP1Q9H305 208 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 SMIM13P0DJ93 91 aa7.76□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 FXYD2P54710 66 aa7.76□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 LINC00158P58513 81 aa7.76□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.76□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.76□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 GAGE10A6NGK3 116 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.74□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 A0A0U1RRA0 63 aa7.74□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 PFN2P35080 140 aa7.74□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 TPRXLQ17RH7 258 aa7.74□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.74□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.74□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.73□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.73□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 DAND5Q8N907 189 aa7.73□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.73□□□□□ -1.17
TTPAL-203ENST00000372906 A0A1B0GWB2 263 aa7.71□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 A4D1N5 150 aa7.71□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 NPC2P61916 151 aa7.71□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 A0A0B4J2C4 111 aa7.7□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 UBE2AP49459 152 aa7.7□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 RAB37Q96AX2 223 aa7.7□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.69□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 K7ERJ3 54 aa7.68□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.68□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 TAX1BP3O14907 124 aa7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 CFC1BP0CG36 223 aa7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 CFC1P0CG37 223 aa7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.66□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 IGKV2D-28P01615 120 aa7.66□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 PRLHP81277 87 aa7.66□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.66□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.66□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.65□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 C9orf118A6NHY6 69 aa7.65□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
TTPAL-203ENST00000372906 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.64□□□□□ -1.19
TTPAL-203ENST00000372906 NDUFC2O95298 119 aa7.64□□□□□ -1.19
TTPAL-203ENST00000372906 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.64□□□□□ -1.19
TTPAL-203ENST00000372906 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-203ENST00000372906 H3BUT2 72 aa7.62□□□□□ -1.19
TTPAL-203ENST00000372906 Q1RN00 199 aa7.62□□□□□ -1.19
TTPAL-203ENST00000372906 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.62□□□□□ -1.19
TTPAL-203ENST00000372906 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.62□□□□□ -1.19
TTPAL-203ENST00000372906 A0A1B0GV90 55 aa7.61□□□□□ -1.19
TTPAL-203ENST00000372906 FABP2P12104 132 aa7.61□□□□□ -1.19
TTPAL-203ENST00000372906 A0A1W2PPM0 123 aa7.6□□□□□ -1.19
TTPAL-203ENST00000372906 H7C2G1 150 aa7.6□□□□□ -1.19
TTPAL-203ENST00000372906 TMEM126AQ9H061 195 aa7.6□□□□□ -1.19
TTPAL-203ENST00000372906 M0R378 163 aa7.59□□□□□ -1.19
TTPAL-203ENST00000372906 PSMB2P49721 201 aa7.59□□□□□ -1.19
TTPAL-203ENST00000372906 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
TTPAL-203ENST00000372906 VAMP3Q15836 100 aa7.59□□□□□ -1.19
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.59□□□□□ -1.19
TTPAL-203ENST00000372906 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.59□□□□□ -1.19
TTPAL-203ENST00000372906 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.58□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 VPREB1P12018 145 aa7.58□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 Q8NDZ9 215 aa7.58□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 COX6CP09669 75 aa7.57□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.57□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.57□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 NCR3O14931 201 aa7.56□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.56□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.56□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.56□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.55□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.55□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.55□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.55□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.54□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 SPRR4Q96PI1 79 aa7.54□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 K7EP34 96 aa7.53□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 TRIAP1O43715 76 aa7.53□□□□□ -1.2
TTPAL-203ENST00000372906 Q8NBF4 154 aa7.52□□□□□ -1.21
TTPAL-203ENST00000372906 IGLV6-57P01721 117 aa7.51□□□□□ -1.21
TTPAL-203ENST00000372906 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.51□□□□□ -1.21
TTPAL-203ENST00000372906 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.51□□□□□ -1.21
TTPAL-203ENST00000372906 UBE2V1Q13404 147 aa7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms