RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 PKD1P98161 4303 aa7.66□□□□□ -1.18
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PTPRK-201ENST00000368202 SNCGO76070 127 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 FABP2P12104 132 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 SCXQ7RTU7 201 aa7.65□□□□□ -1.18
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PTPRK-201ENST00000368202 H0YGX0 51 aa7.64□□□□□ -1.19
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PTPRK-201ENST00000368202 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRK-201ENST00000368202 K7EP34 96 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPRK-201ENST00000368202 XGP55808 180 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPRK-201ENST00000368202 TRACP01848 142 aa7.53□□□□□ -1.2
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PTPRK-201ENST00000368202 H3BMG7 143 aa7.52□□□□□ -1.21
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PTPRK-201ENST00000368202 Q6ZQY7 126 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRK-201ENST00000368202 ERC2-IT1O76042 136 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRK-201ENST00000368202 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRK-201ENST00000368202 F8W1H4 67 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRK-201ENST00000368202 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.41□□□□□ -1.22
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PTPRK-201ENST00000368202 F8WEM9 126 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-201ENST00000368202 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-201ENST00000368202 Q5VSD8 79 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRK-201ENST00000368202 Q8N377 158 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-201ENST00000368202 PRO0461Q9UI25 63 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-201ENST00000368202 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-201ENST00000368202 HSPG2P98160 4391 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-201ENST00000368202 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-201ENST00000368202 SPRR1BP22528 89 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-201ENST00000368202 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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