RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COPS4Q9BT78 406 aa-5.84□□□□□ -3.34
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM167BQ9NRX6 74 aa-5.84□□□□□ -3.34
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NDUFA2O43678 99 aa-5.85□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-5.85□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPANXN3Q5MJ09 141 aa-5.85□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FUNDC1Q8IVP5 155 aa-5.85□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCL13Q99616 98 aa-5.85□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMIM7Q9BQ49 75 aa-5.85□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANAPC13Q9BS18 74 aa-5.85□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TXLNGYQ9BZA5 131 aa-5.85□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GRPEL1Q9HAV7 217 aa-5.85□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00032P0C843 101 aa-5.86□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SERPINB1P30740 379 aa-5.86□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GABARAPL2P60520 117 aa-5.86□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-5.86□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BORCS8Q96FH0 119 aa-5.86□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 S100A14Q9HCY8 104 aa-5.86□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-5.87□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1W2PPC4 97 aa-5.87□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCGNO76038 276 aa-5.87□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MPC2O95563 127 aa-5.87□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SVIPQ8NHG7 77 aa-5.87□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST1H2BLQ99880 126 aa-5.87□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCBD2Q9H0N5 130 aa-5.87□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNE3Q9Y6H6 103 aa-5.87□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCGB1D2O95969 90 aa-5.88□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMIM13P0DJ93 91 aa-5.88□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC70Q6NSX1 233 aa-5.88□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UTS2BQ765I0 119 aa-5.88□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP-5.88□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CGREF1Q99674 301 aa-5.88□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP-5.88□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa-5.89□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC179H3BU77 68 aa-5.89□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PSME3P61289 254 aa-5.89□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLGLAQ15195 96 aa-5.89□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C10orf53Q8N6V4 93 aa-5.89□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PKIBQ9C010 78 aa-5.89□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SYNCQ9H7C4 482 aa-5.89□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RAB9BQ9NP90 201 aa-5.89□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1W2PPL8 197 aa-5.9□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OOEPA6NGQ2 149 aa-5.9□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 G3V2T6 193 aa-5.9□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC150Q8NCX0 1101 aa-5.9□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHMP4AQ9BY43 222 aa-5.9□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NACAP1Q9BZK3 213 aa-5.9□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TPRKBQ9Y3C4 175 aa-5.9□□□□□ -3.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPL31P62899 125 aaKnown RBP-5.91□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SELENOWP63302 87 aa-5.91□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RGS1Q08116 209 aa-5.91□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYH16Q9H6N6 1097 aa-5.91□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GLTPQ9NZD2 209 aa-5.91□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP-5.91□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A0U1RQV5 110 aa-5.92□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYL12BO14950 172 aa-5.92□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GCGP01275 180 aa-5.92□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP-5.92□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HSPB3Q12988 150 aa-5.92□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa-5.92□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CXorf40BQ96DE9 158 aa-5.92□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATP5HO75947 161 aa-5.93□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CSTBP04080 98 aaKnown RBP-5.93□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC175P0C221 793 aa-5.93□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COX8CQ7Z4L0 72 aa-5.93□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UCMAQ8WVF2 138 aa-5.93□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPANXDQ9BXN6 97 aa-5.93□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DPY30Q9C005 99 aa-5.93□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM216Q9P0N5 145 aa-5.93□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC182A6NF36 153 aa-5.94□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 E7ESA3 106 aa-5.94□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PSPHP78330 225 aa-5.94□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LZTFL1Q9NQ48 299 aa-5.94□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SYCE1LA8MT33 242 aa-5.95□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 K7EIM0 57 aa-5.95□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 S100A4P26447 101 aaKnown RBP-5.95□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CBX1P83916 185 aa-5.95□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q56UQ5 140 aa-5.95□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C1orf189Q5VU69 101 aa-5.95□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM45BPQ6NSW5 357 aa-5.95□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OTUD6BQ8N6M0 293 aa-5.95□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP-5.95□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BCAP29Q9UHQ4 241 aa-5.95□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRO0628Q9UI54 55 aa-5.95□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIGD1AQ9Y241 93 aa-5.95□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CIB2O75838 187 aa-5.96□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP-5.96□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYL5Q02045 173 aa-5.96□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMIM8Q96KF7 97 aa-5.96□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CENPKQ9BS16 269 aa-5.96□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP-5.96□□□□□ -3.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1B0GUT8 65 aa-5.97□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SYCE3A1L190 88 aa-5.97□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP-5.97□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP-5.97□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VAMP3Q15836 100 aa-5.97□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMIM5Q71RC9 77 aa-5.97□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC83Q8IWF9 413 aa-5.97□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHMP3Q9Y3E7 222 aa-5.97□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HSPB11Q9Y547 144 aa-5.97□□□□□ -3.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa-5.97□□□□□ -3.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116 ms