RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.62□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.61□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.61□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF861PO60384 105 aa4.61□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.61□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.61□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 SPANXCQ9NY87 97 aa4.61□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 LPAP08519 4548 aa4.61□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 GAGE10A6NGK3 116 aa4.6□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 PRYO14603 147 aa4.6□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.6□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 DAND5Q8N907 189 aa4.6□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 VAMP8Q9BV40 100 aa4.6□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.6□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.59□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV2D-28P01615 120 aa4.59□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2AP49459 152 aa4.59□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.59□□□□□ -1.67
SGMS1-201ENST00000361543 DLEU1O43261 78 aa4.58□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 DDTP30046 118 aa4.58□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 PCP4P48539 62 aa4.58□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.58□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 PCP2Q8IVA1 136 aa4.58□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 LITAFQ99732 161 aa4.58□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.58□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM126AQ9H061 195 aa4.58□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.58□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 NCR3O14931 201 aa4.57□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 COX8AP10176 69 aa4.57□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.57□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.56□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.56□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.56□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV6-57P01721 117 aa4.56□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 NPC2P61916 151 aa4.56□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA45Q537H7 98 aa4.56□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 PYY3Q5JQD4 70 aa4.56□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.56□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.56□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.56□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 Q8NDZ9 215 aa4.56□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.55□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 A0A087X002 238 aa4.55□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.55□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.55□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.55□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.55□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.55□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 SPRR1AP35321 89 aa4.54□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 PRLHP81277 87 aa4.54□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 LCE1DQ5T752 114 aa4.54□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H4GQ99525 98 aa4.54□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 HIGD1BQ9P298 99 aa4.54□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.53□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 CRYGAP11844 174 aa4.53□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.53□□□□□ -1.68
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.52□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 A6NDN8 102 aa4.52□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.52□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.52□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 C14orf144Q96I85 54 aa4.52□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.52□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.52□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 A4D1N5 150 aa4.51□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 TAL2Q16559 108 aa4.51□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZRX8 168 aa4.51□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.51□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 TSPAN13O95857 204 aa4.5□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM6P0DI80 62 aa4.5□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 VAMP3Q15836 100 aa4.5□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 PRR4Q16378 134 aa4.5□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.5□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.5□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GWB2 263 aa4.49□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 SNCGO76070 127 aa4.48□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 COX7BP24311 80 aa4.48□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.48□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 RAB37Q96AX2 223 aa4.48□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A20O43772 301 aa4.47□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 HSD52Q0P140 79 aa4.47□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 C6orf99Q4VX62 202 aa4.47□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.47□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.47□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.47□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 SPRR4Q96PI1 79 aa4.47□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.47□□□□□ -1.69
SGMS1-201ENST00000361543 MUC2Q02817 5179 aa4.46□□□□□ -1.7
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0B4J2C4 111 aa4.46□□□□□ -1.7
SGMS1-201ENST00000361543 CTAG1AP78358 180 aa4.46□□□□□ -1.7
SGMS1-201ENST00000361543 CEND1Q8N111 149 aa4.46□□□□□ -1.7
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.46□□□□□ -1.7
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.45□□□□□ -1.7
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