RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 PSPHP1O15172 72 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP4-201ENST00000344528 TLX1NBP0CAT3 122 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-201ENST00000344528 ACYP2P14621 99 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-201ENST00000344528 C8orf87E5RJ46 101 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-201ENST00000344528 A8MWP4 228 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-201ENST00000344528 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF861PO60384 105 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-201ENST00000344528 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-201ENST00000344528 CHD9Q3L8U1 2897 aa10.71□□□□□ -0.69
SH3BP4-201ENST00000344528 PMAIP1Q13794 54 aa10.71□□□□□ -0.69
SH3BP4-201ENST00000344528 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf195Q5TG92 126 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP4-201ENST00000344528 APLNQ9ULZ1 77 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP4-201ENST00000344528 Q96NJ1 140 aa10.67□□□□□ -0.7
SH3BP4-201ENST00000344528 IGFL1Q6UW32 110 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-201ENST00000344528 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1B0GU69 56 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-201ENST00000344528 CNBPP62633 177 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-201ENST00000344528 K7EQZ3 153 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC00336Q6ZUF6 198 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-201ENST00000344528 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-201ENST00000344528 Q8N377 158 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-201ENST00000344528 J3QL48 77 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF575Q86XF7 245 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF292O60281 2723 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP4-201ENST00000344528 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC00304Q8N9R0 145 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP4-201ENST00000344528 CASC10Q5T4H9 136 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP4-201ENST00000344528 WIPF1O43516 503 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PNN7 141 aa10.58□□□□□ -0.72
SH3BP4-201ENST00000344528 PRR15Q8IV56 129 aa10.58□□□□□ -0.72
SH3BP4-201ENST00000344528 C5orf42Q9H799 3197 aa10.58□□□□□ -0.72
SH3BP4-201ENST00000344528 HTTP42858 3142 aa10.58□□□□□ -0.72
SH3BP4-201ENST00000344528 ERC2-IT1O76042 136 aa10.58□□□□□ -0.72
SH3BP4-201ENST00000344528 IGLV7-43P04211 117 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP4-201ENST00000344528 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS28P62857 69 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
SH3BP4-201ENST00000344528 C8orf17Q9NRJ1 99 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP4-201ENST00000344528 STAB1Q9NY15 2570 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1B0GVX0 72 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP4-201ENST00000344528 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
SH3BP4-201ENST00000344528 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
SH3BP4-201ENST00000344528 SPRR4Q96PI1 79 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 DSCR10P59022 87 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 PCNTO95613 3336 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 TRANK1O15050 2925 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 ANAPC11Q9NYG5 84 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0G2JQZ4 141 aa10.46□□□□□ -0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa10.46□□□□□ -0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 AKAP13Q12802 2813 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 MGAQ8IWI9 3026 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PNM2 257 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 TEX15Q9BXT5 2789 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 PRO0628Q9UI54 55 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 COL6A5A8TX70 2615 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 TNP2Q05952 138 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 KLKP1Q107X0 134 aa10.4□□□□□ -0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 COA5Q86WW8 74 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 COX6B2Q6YFQ2 88 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 C9orf92A6NGG3 77 aa10.38□□□□□ -0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 UNC79Q9P2D8 2635 aa10.38□□□□□ -0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 CHD6Q8TD26 2715 aa10.38□□□□□ -0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 CR1P17927 2039 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM104AQ969W3 186 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC01600Q96MT4 127 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 LAMA3Q16787 3333 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 C4orf26Q17RF5 130 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 CD164Q04900 197 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 NOTCH1P46531 2555 aa10.27□□□□□ -0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 UQCR11O14957 56 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 IGSF10Q6WRI0 2623 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 DSPP15924 2871 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 A8MUN3 132 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 CFAP54Q96N23 3096 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 H7BZZ5 65 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 WDFY4Q6ZS81 3184 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM229BQ4G0N7 80 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 PLAC8Q9NZF1 115 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0C4DFX4 3053 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-201ENST00000344528 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-201ENST00000344528 BAHCC1Q9P281 2608 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-201ENST00000344528 SPRR1AP35321 89 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP4-201ENST00000344528 PRR26Q8N8Z3 221 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP4-201ENST00000344528 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
SH3BP4-201ENST00000344528 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
SH3BP4-201ENST00000344528 MIR22HGQ0VDD5 57 aa10.12□□□□□ -0.79
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
SH3BP4-201ENST00000344528 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.5 ms