RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326197.11

SCMH1-201, Transcript of Scm polycomb group protein homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCMH1, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1-201ENST00000326197 VWFP04275 2813 aa6.75□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 WIPF1O43516 503 aa6.75□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.75□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 PRR34Q9NV39 138 aa6.75□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 AKAP9Q99996 3911 aa6.75□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 Q8NAQ8 132 aa6.74□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 A0A0U1RQV1 116 aa6.74□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 PRYO14603 147 aa6.74□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.74□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.73□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 PRO0628Q9UI54 55 aa6.73□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.73□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.73□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.72□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 SYCNQ0VAF6 134 aa6.72□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.71□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 IGKV4-1P06312 121 aa6.71□□□□□ -1.33
SCMH1-201ENST00000326197 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.71□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 RETNQ9HD89 108 aa6.71□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 Q6ZRP5 223 aa6.7□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.7□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 SMIM29Q86T20 159 aa6.69□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 UBE2BP63146 152 aa6.68□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 Q6ZTC4 211 aa6.68□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 PRR4Q16378 134 aa6.68□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 C7orf33Q8WU49 177 aa6.68□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 C1orf137Q5JT78 98 aa6.67□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 C15orf56Q8N910 161 aa6.67□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 ESRGQ1W209 222 aa6.67□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 Q8N377 158 aa6.66□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 INAFM1C9JVW0 142 aa6.66□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.66□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 OCR1Q9BZK8 76 aa6.66□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.65□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 EPM2AB3EWF7 344 aa6.65□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 ERC2-IT1O76042 136 aa6.65□□□□□ -1.34
SCMH1-201ENST00000326197 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.65□□□□□ -1.35
SCMH1-201ENST00000326197 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.64□□□□□ -1.35
SCMH1-201ENST00000326197 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.64□□□□□ -1.35
SCMH1-201ENST00000326197 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.63□□□□□ -1.35
SCMH1-201ENST00000326197 FAM168BA1KXE4 195 aa6.62□□□□□ -1.35
SCMH1-201ENST00000326197 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.62□□□□□ -1.35
SCMH1-201ENST00000326197 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.62□□□□□ -1.35
SCMH1-201ENST00000326197 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.62□□□□□ -1.35
SCMH1-201ENST00000326197 A0A1W2PNM2 257 aa6.61□□□□□ -1.35
SCMH1-201ENST00000326197 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.61□□□□□ -1.35
SCMH1-201ENST00000326197 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.61□□□□□ -1.35
SCMH1-201ENST00000326197 Q6ZRX8 168 aa6.61□□□□□ -1.35
SCMH1-201ENST00000326197 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SCMH1-201ENST00000326197 Q8NBF4 154 aa6.6□□□□□ -1.35
SCMH1-201ENST00000326197 C1orf195Q5TG92 126 aa6.59□□□□□ -1.35
SCMH1-201ENST00000326197 A0A0G2JQZ4 141 aa6.59□□□□□ -1.35
SCMH1-201ENST00000326197 A0A1W2PNN7 141 aa6.59□□□□□ -1.35
SCMH1-201ENST00000326197 K7EQZ3 153 aa6.59□□□□□ -1.35
SCMH1-201ENST00000326197 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.59□□□□□ -1.35
SCMH1-201ENST00000326197 NOTCH1P46531 2555 aa6.58□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.58□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.58□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 PSPHP1O15172 72 aa6.58□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.58□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 Q9BRP9 147 aa6.58□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.57□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 MP68P56378 58 aa6.56□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 HCG22E2RYF7 251 aa6.55□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 H3BNG1 76 aa6.55□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.55□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.55□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 PSCAO43653 123 aa6.55□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.54□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 TENM3Q9P273 2699 aa6.54□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 A0A087WSZ3 146 aa6.54□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 F8WDY8 70 aa6.54□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 DSCR10P59022 87 aa6.54□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 CASC10Q5T4H9 136 aa6.54□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.54□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 LINC00208Q96KT6 92 aa6.53□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 hDV103S1A0JD37 113 aa6.53□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 PRLHP81277 87 aa6.53□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 V9GYY9 64 aa6.53□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 A0A1B0GW54 56 aa6.52□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 REG3GQ6UW15 175 aa6.52□□□□□ -1.36
SCMH1-201ENST00000326197 A0A096LNI7 61 aa6.52□□□□□ -1.37
SCMH1-201ENST00000326197 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SCMH1-201ENST00000326197 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SCMH1-201ENST00000326197 UBE2AP49459 152 aa6.5□□□□□ -1.37
SCMH1-201ENST00000326197 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.5□□□□□ -1.37
SCMH1-201ENST00000326197 NDUFB1O75438 58 aa6.49□□□□□ -1.37
SCMH1-201ENST00000326197 SPRR4Q96PI1 79 aa6.49□□□□□ -1.37
SCMH1-201ENST00000326197 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.48□□□□□ -1.37
SCMH1-201ENST00000326197 KRTAP10-11P60412 298 aa6.48□□□□□ -1.37
SCMH1-201ENST00000326197 IGFL1Q6UW32 110 aa6.48□□□□□ -1.37
SCMH1-201ENST00000326197 TNP2Q05952 138 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms