RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316786.1

C9orf106-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 106 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf106, Length 3,145 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf106-201ENST00000316786 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf106-201ENST00000316786 H3BNG1 76 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf106-201ENST00000316786 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf106-201ENST00000316786 Q6ZRP5 223 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf106-201ENST00000316786 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf106-201ENST00000316786 UBE2BP63146 152 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf106-201ENST00000316786 CRPP02741 224 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf106-201ENST00000316786 A8MUN3 132 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 PRR34Q9NV39 138 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 LINC00158P58513 81 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 LYSTQ99698 3801 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 NREPQ16612 68 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 Q6ZVQ6 151 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 BCE1O60756 84 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 DNHD1Q96M86 4753 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 PRYO14603 147 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 SCXQ7RTU7 201 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 NDUFS5O43920 106 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 SYCNQ0VAF6 134 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 KIAA0087Q14695 138 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 Q8IZM0 81 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 TENM2Q9NT68 2774 aa8.85□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.85□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.85□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 Q1T7F1 81 aa8.85□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
C9orf106-201ENST00000316786 VPREB1P12018 145 aa8.83□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.83□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 C10orf25Q5T742 122 aa8.83□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 CCL18P55774 89 aa8.82□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 PRR4Q16378 134 aa8.82□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 SPAG11BQ08648 103 aa8.82□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.82□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 hDV103S1A0JD37 113 aa8.81□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 H0YGX0 51 aa8.81□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.81□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.81□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.81□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.81□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.8□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.8□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.79□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 C16orf90A8MZG2 172 aa8.79□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 HCG22E2RYF7 251 aa8.79□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 IGKV2D-28P01615 120 aa8.79□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.79□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.79□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.79□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 BPY2O14599 106 aa8.79□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.78□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.78□□□□□ -1
C9orf106-201ENST00000316786 UBE2AP49459 152 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 LCA10Q71F78 164 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 B9D2Q9BPU9 175 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 C15orf56Q8N910 161 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 Q8NDZ9 215 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 A6NED7 52 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 COX17Q14061 63 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 M0R2N4 97 aa8.71□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 CASC10Q5T4H9 136 aa8.71□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 DIRC1Q969H9 104 aa8.71□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.71□□□□□ -1.01
C9orf106-201ENST00000316786 Q5VV11 94 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf106-201ENST00000316786 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf106-201ENST00000316786 Q8N9L7 120 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf106-201ENST00000316786 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf106-201ENST00000316786 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf106-201ENST00000316786 PRR15LQ9BU68 103 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf106-201ENST00000316786 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
C9orf106-201ENST00000316786 A6NN06 94 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf106-201ENST00000316786 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf106-201ENST00000316786 PSCAO43653 123 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf106-201ENST00000316786 ERC2-IT1O76042 136 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf106-201ENST00000316786 CXCL6P80162 114 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf106-201ENST00000316786 APLNQ9ULZ1 77 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf106-201ENST00000316786 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
C9orf106-201ENST00000316786 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.65□□□□□ -1.03
C9orf106-201ENST00000316786 PRAC1Q96KF2 57 aa8.65□□□□□ -1.03
C9orf106-201ENST00000316786 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf106-201ENST00000316786 Q6ZQT0 140 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf106-201ENST00000316786 TGP01266 2768 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf106-201ENST00000316786 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf106-201ENST00000316786 Q8N814 137 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms