RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NF1P21359 2839 aa14.88□□□□□ -0.03
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa14.85□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SONP18583 2426 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa14.77□□□□□ -0.04
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BAHCC1Q9P281 2608 aa14.76□□□□□ -0.05
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa14.74□□□□□ -0.05
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NDUFB1O75438 58 aa14.73□□□□□ -0.05
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A8MUN3 132 aa14.69□□□□□ -0.06
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WFDC10BQ8IUB3 73 aa14.69□□□□□ -0.06
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SYCNQ0VAF6 134 aa14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 Q9BRP9 147 aa14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ITPR3Q14573 2671 aa14.66□□□□□ -0.06
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HECTD1Q9ULT8 2610 aa14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CD164Q04900 197 aa14.65□□□□□ -0.07
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 B9D2Q9BPU9 175 aa14.61□□□□□ -0.07
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MP68P56378 58 aa14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBE2BP63146 152 aa14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPL37AP8A6NKH3 93 aa14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP1-1Q07627 177 aa14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A8MU10 97 aa14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC168Q8NDH2 2452 aa14.57□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa14.56□□□□□ -0.08
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBE2AP49459 152 aa14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa14.54□□□□□ -0.08
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LIMD2Q9BT23 127 aa14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa14.53□□□□□ -0.08
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WFDC13Q8IUB5 93 aa14.5□□□□□ -0.09
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 H3BPC8 53 aa14.49□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C16orf90A8MZG2 172 aa14.48□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa14.48□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM168BA1KXE4 195 aa14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DEFB116Q30KQ4 102 aa14.45□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LINC01556Q5JQF7 62 aa14.45□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MTORP42345 2549 aa14.43□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGFL1Q6UW32 110 aa14.43□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRR15LQ9BU68 103 aa14.42□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 H0Y9P7 68 aa14.41□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UNC79Q9P2D8 2635 aa14.41□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa14.41□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 Q75L30 129 aa14.4□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A0G2JQZ4 141 aa14.39□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A1W2PNN7 141 aa14.39□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa14.39□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C9orf163Q8N9P6 203 aa14.38□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NOTCH2Q04721 2471 aa14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A087WSZ3 146 aa14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LCA10Q71F78 164 aa14.36□□□□□ -0.11
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