RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV2D-28P01615 120 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-215ENST00000628018 GAGE2EQ4V326 116 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-215ENST00000628018 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-215ENST00000628018 GAGE2DQ9UEU5 116 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-215ENST00000628018 Q8NDZ9 215 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-215ENST00000628018 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa16.07■□□□□ 0.16
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GV90 55 aa16.07■□□□□ 0.16
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPAN13O95857 204 aa16.07■□□□□ 0.16
CAPNS1-215ENST00000628018 H3BUT2 72 aa16.06■□□□□ 0.16
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CAPNS1-215ENST00000628018 PRR3P79522 188 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-215ENST00000628018 C9orf163Q8N9P6 203 aa16.04■□□□□ 0.16
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CAPNS1-215ENST00000628018 VPREB1P12018 145 aa15.99■□□□□ 0.15
CAPNS1-215ENST00000628018 TNP2Q05952 138 aa15.99■□□□□ 0.15
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CAPNS1-215ENST00000628018 Q1RN00 199 aa15.99■□□□□ 0.15
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CAPNS1-215ENST00000628018 C16orf90A8MZG2 172 aa15.97■□□□□ 0.15
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CAPNS1-215ENST00000628018 FABP2P12104 132 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1-215ENST00000628018 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM126AQ9H061 195 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMB2P49721 201 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC01620Q4KN68 170 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIAP1O43715 76 aa15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-215ENST00000628018 VAMP3Q15836 100 aa15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM168BA1KXE4 195 aa15.9■□□□□ 0.14
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-215ENST00000628018 M0R378 163 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV6-57P01721 117 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL28P46779 137 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-215ENST00000628018 S100A7L2Q5SY68 101 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-215ENST00000628018 SMIM11BQ8TCY0 68 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-215ENST00000628018 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPNS1-215ENST00000628018 LYRM7Q5U5X0 104 aa15.86■□□□□ 0.13
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CAPNS1-215ENST00000628018 SPCS1Q9Y6A9 102 aa15.86■□□□□ 0.13
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CAPNS1-215ENST00000628018 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa15.84■□□□□ 0.13
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CAPNS1-215ENST00000628018 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPNS1-215ENST00000628018 K7EP34 96 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPNS1-215ENST00000628018 COX6CP09669 75 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPNS1-215ENST00000628018 GAGE10A6NGK3 116 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00474Q9P2X8 69 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-215ENST00000628018 FAT2Q9NYQ8 4349 aa15.82■□□□□ 0.12
CAPNS1-215ENST00000628018 C7orf33Q8WU49 177 aa15.82■□□□□ 0.12
CAPNS1-215ENST00000628018 C22orf24Q9Y442 160 aa15.82■□□□□ 0.12
CAPNS1-215ENST00000628018 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PNN7 141 aa15.81■□□□□ 0.12
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP10-2P60368 255 aa15.8■□□□□ 0.12
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CAPNS1-215ENST00000628018 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa15.79■□□□□ 0.12
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAH11Q96DT5 4516 aa15.79■□□□□ 0.12
CAPNS1-215ENST00000628018 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa15.78■□□□□ 0.12
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CAPNS1-215ENST00000628018 UBE2V1Q13404 147 aa15.78■□□□□ 0.12
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa15.77■□□□□ 0.11
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CAPNS1-215ENST00000628018 SPACA4Q8TDM5 124 aa15.77■□□□□ 0.11
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00167Q96N53 147 aa15.76■□□□□ 0.11
CAPNS1-215ENST00000628018 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00336Q6ZUF6 198 aa15.75■□□□□ 0.11
CAPNS1-215ENST00000628018 M0QXV9 152 aa15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-215ENST00000628018 C6orf99Q4VX62 202 aa15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-215ENST00000628018 CLEC2BQ92478 149 aa15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-215ENST00000628018 CBY1Q9Y3M2 126 aa15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-215ENST00000628018 H0YGX0 51 aa15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-215ENST00000628018 H3BMG7 143 aa15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNQ1DNQ9H478 68 aa15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-215ENST00000628018 EPM2AB3EWF7 344 aa15.71■□□□□ 0.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ATXN8Q156A1 80 aa15.71■□□□□ 0.11
CAPNS1-215ENST00000628018 PKD1P98161 4303 aa15.71■□□□□ 0.1
CAPNS1-215ENST00000628018 RYR2Q92736 4967 aa15.7■□□□□ 0.1
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL37AP8A6NKH3 93 aa15.7■□□□□ 0.1
CAPNS1-215ENST00000628018 LST1O00453 97 aa15.7■□□□□ 0.1
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