RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625282.2

SPTAN1-210, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 4,102 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-210ENST00000625282 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.31□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 LINC01006Q8NI28 216 aa6.31□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 HTN3P15516 51 aa6.31□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 PRR4Q16378 134 aa6.31□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.31□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.31□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.31□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 TMEM89A2RUT3 159 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 CXCL6P80162 114 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 CELA1Q9UNI1 258 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 IGLV1-40P01703 118 aa6.28□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 PDE6GP18545 87 aa6.28□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.28□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.27□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 LINC00575Q6W349 94 aa6.27□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 ESM1Q9NQ30 184 aa6.27□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 MUC7Q8TAX7 377 aa6.27□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.27□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.27□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 A0A096LNT2 108 aa6.26□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.26□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.26□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 DEFB130BP0DP73 79 aa6.26□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 DEFB130AP0DP74 79 aa6.26□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 A0A096LPF7 62 aa6.25□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.25□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.25□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 LINC00167Q96N53 147 aa6.25□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.24□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 C3orf84H3BNL1 204 aa6.24□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 PRR15Q8IV56 129 aa6.24□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.24□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 STAB1Q9NY15 2570 aa6.24□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 ZANQ9Y493 2812 aa6.24□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 C6orf223Q8N319 242 aa6.24□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 CD164Q04900 197 aa6.23□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.23□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.23□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.23□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 COL6A5A8TX70 2615 aa6.22□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.22□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.22□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.22□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.22□□□□□ -1.41
SPTAN1-210ENST00000625282 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 Q8IZM0 81 aa6.21□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 DIRC1Q969H9 104 aa6.21□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 APCP25054 2843 aa6.21□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.2□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.2□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.2□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 TENM4Q6N022 2769 aa6.2□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 A8MUN3 132 aa6.2□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 CUBNO60494 3623 aa6.2□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.2□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 Q6ZTC4 211 aa6.2□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.2□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 FSHBP01225 129 aa6.19□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.19□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.19□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 ERC2-IT1O76042 136 aa6.19□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 Q6ZRU5 148 aa6.19□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.19□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.18□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 Q6ZRP5 223 aa6.18□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.18□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 hDV103S1A0JD37 113 aa6.18□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 DEFB4AO15263 64 aa6.18□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 SMIM29Q86T20 159 aa6.18□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 COX7BP24311 80 aa6.18□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 DEFB135Q30KP9 77 aa6.18□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 KLK12Q9UKR0 248 aa6.18□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 APOC4P55056 127 aa6.18□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 CR1P17927 2039 aa6.17□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 GYPEP15421 78 aa6.17□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 OCR1Q9BZK8 76 aa6.17□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 H3BQ85 93 aa6.16□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 UBE2BP63146 152 aa6.16□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 IGKV4-1P06312 121 aa6.16□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.16□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 HIVEP1P15822 2718 aa6.16□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 COX17Q14061 63 aa6.15□□□□□ -1.42
SPTAN1-210ENST00000625282 SPAG11BQ08648 103 aa6.15□□□□□ -1.43
SPTAN1-210ENST00000625282 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.15□□□□□ -1.43
SPTAN1-210ENST00000625282 C10orf25Q5T742 122 aa6.14□□□□□ -1.43
SPTAN1-210ENST00000625282 Q1T7F1 81 aa6.14□□□□□ -1.43
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