RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619193.4

RDM1-223, Transcript of RAD52 motif containing 1, human

TSL 1 (best)

Gene RDM1, Length 686 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDM1-223	ENST00000619193	HILS1	P60008	231 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193		A0A1B0GX51	115 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	NCR3	O14931	201 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	SLPI	P03973	132 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	PFN2	P35080	140 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	HERC2	O95714	4834 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	CCK	P06307	115 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	COX7C	P15954	63 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	XCL1	P47992	114 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	UQCRQ	O14949	82 aa		4	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	CRYGA	P11844	174 aa		4	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193		Q8N814	137 aa		4	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193		Q8NAQ8	132 aa		4	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193		A0A0J9YWU9	116 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193		M0R2N4	97 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	COX17	Q14061	63 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	LINC00575	Q6W349	94 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	PRR34	Q9NV39	138 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	CELA1	Q9UNI1	258 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193		A0A087WVE0	104 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193		H3BS24	57 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	IGLV6-57	P01721	117 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	C6orf223	Q8N319	242 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	MRAP	Q8TCY5	172 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193		A0A096LPF7	62 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	ATOX1	O00244	68 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	OXT	P01178	125 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	REG3A	Q06141	175 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	ENHO	Q6UWT2	76 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193		Q6ZQT0	140 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RDM1-223	ENST00000619193	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	DNAL4	O96015	105 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	MUC7	Q8TAX7	377 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	hADV29S1	A0JD25	119 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	USP17L23	D6RBM5	183 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	DEFB4A	O15263	64 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	SPAG11B	Q08648	103 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	C6orf99	Q4VX62	202 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	LELP1	Q5T871	98 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	SERP2	Q8N6R1	65 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	RYR1	P21817	5038 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	LCE6A	A0A183	80 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	VPREB1	P12018	145 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	DEFB135	Q30KP9	77 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	EPM2A	B3EWF7	344 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	LCE3B	Q5TA77	95 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	CFAP161	Q6P656	301 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	TENM3	Q9P273	2699 aa		3.93	□□□□□ -1.78

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