RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599421.1

LINC00649-210, long intergenic non-protein coding RNA 649, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00649, Length 728 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00649-210ENST00000599421 Q6ZVH6 145 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00649-210ENST00000599421 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00649-210ENST00000599421 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LINC00649-210ENST00000599421 MT1HL1P0DM35 61 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00649-210ENST00000599421 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LINC00649-210ENST00000599421 COPS9Q8WXC6 57 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00649-210ENST00000599421 C2orf48Q96LS8 159 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00649-210ENST00000599421 PTTG1IPP53801 180 aa6.14□□□□□ -1.43
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LINC00649-210ENST00000599421 C2orf82Q6UX34 121 aa6.14□□□□□ -1.43
LINC00649-210ENST00000599421 CEND1Q8N111 149 aa6.14□□□□□ -1.43
LINC00649-210ENST00000599421 C15orf56Q8N910 161 aa6.14□□□□□ -1.43
LINC00649-210ENST00000599421 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.14□□□□□ -1.43
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LINC00649-210ENST00000599421 SPANXCQ9NY87 97 aa6.14□□□□□ -1.43
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LINC00649-210ENST00000599421 USP17L23D6RBM5 183 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00649-210ENST00000599421 SMIM13P0DJ93 91 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00649-210ENST00000599421 IFITM1P13164 125 aa6.13□□□□□ -1.43
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LINC00649-210ENST00000599421 C14orf177Q52M58 125 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00649-210ENST00000599421 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00649-210ENST00000599421 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00649-210ENST00000599421 A0A0U1RRA0 63 aa6.12□□□□□ -1.43
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LINC00649-210ENST00000599421 PFN2P35080 140 aa6.12□□□□□ -1.43
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LINC00649-210ENST00000599421 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00649-210ENST00000599421 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.12□□□□□ -1.43
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LINC00649-210ENST00000599421 SYCNQ0VAF6 134 aa6.11□□□□□ -1.43
LINC00649-210ENST00000599421 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
LINC00649-210ENST00000599421 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.11□□□□□ -1.43
LINC00649-210ENST00000599421 RNF151Q2KHN1 245 aa6.1□□□□□ -1.43
LINC00649-210ENST00000599421 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.1□□□□□ -1.43
LINC00649-210ENST00000599421 C10orf25Q5T742 122 aa6.1□□□□□ -1.43
LINC00649-210ENST00000599421 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.1□□□□□ -1.43
LINC00649-210ENST00000599421 DAND5Q8N907 189 aa6.1□□□□□ -1.43
LINC00649-210ENST00000599421 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
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LINC00649-210ENST00000599421 Q6ZRU5 148 aa6.09□□□□□ -1.43
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LINC00649-210ENST00000599421 CARD19Q96LW7 228 aa6.09□□□□□ -1.43
LINC00649-210ENST00000599421 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.09□□□□□ -1.43
LINC00649-210ENST00000599421 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.09□□□□□ -1.43
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LINC00649-210ENST00000599421 PANO1I0J062 215 aa6.06□□□□□ -1.44
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LINC00649-210ENST00000599421 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.05□□□□□ -1.44
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LINC00649-210ENST00000599421 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.05□□□□□ -1.44
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LINC00649-210ENST00000599421 A0A1B0GWB2 263 aa6.04□□□□□ -1.44
LINC00649-210ENST00000599421 SLPIP03973 132 aa6.04□□□□□ -1.44
LINC00649-210ENST00000599421 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.04□□□□□ -1.44
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LINC00649-210ENST00000599421 CFC1P0CG37 223 aa6.04□□□□□ -1.44
LINC00649-210ENST00000599421 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.04□□□□□ -1.44
LINC00649-210ENST00000599421 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.04□□□□□ -1.44
LINC00649-210ENST00000599421 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.03□□□□□ -1.44
LINC00649-210ENST00000599421 NDUFC2O95298 119 aa6.03□□□□□ -1.44
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LINC00649-210ENST00000599421 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.03□□□□□ -1.44
LINC00649-210ENST00000599421 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.02□□□□□ -1.45
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LINC00649-210ENST00000599421 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 TAX1BP3O14907 124 aa6.01□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 Q6ZRP5 223 aa6.01□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.01□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 C9orf118A6NHY6 69 aa6□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 GAGE2BQ13066 116 aa6□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 Q1RN00 199 aa6□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 C9orf163Q8N9P6 203 aa6□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.99□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.98□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.98□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 H3BUT2 72 aa5.98□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 H7C2G1 150 aa5.98□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 IGKV2D-28P01615 120 aa5.98□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 CHTF8P0CG12 524 aa5.98□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.98□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.98□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 TSPAN13O95857 204 aa5.97□□□□□ -1.45
LINC00649-210ENST00000599421 PSMB2P49721 201 aa5.97□□□□□ -1.45
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