RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597360.5

PDE4C-211, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4C, Length 3,511 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-211ENST00000597360 A0A096LNT2 108 aa10.7□□□□□ -0.7
PDE4C-211ENST00000597360 C3orf84H3BNL1 204 aa10.7□□□□□ -0.7
PDE4C-211ENST00000597360 NDUFC1O43677 76 aa10.7□□□□□ -0.7
PDE4C-211ENST00000597360 DEFB105AQ8NG35 78 aa10.69□□□□□ -0.7
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PDE4C-211ENST00000597360 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
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PDE4C-211ENST00000597360 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa10.66□□□□□ -0.7
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PDE4C-211ENST00000597360 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa10.64□□□□□ -0.71
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PDE4C-211ENST00000597360 LY6G6DO95868 133 aa10.64□□□□□ -0.71
PDE4C-211ENST00000597360 ESRGQ1W209 222 aa10.64□□□□□ -0.71
PDE4C-211ENST00000597360 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PDE4C-211ENST00000597360 Q8IZM0 81 aa10.64□□□□□ -0.71
PDE4C-211ENST00000597360 C16orf95Q9H693 158 aa10.64□□□□□ -0.71
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PDE4C-211ENST00000597360 ACANP16112 2415 aa10.61□□□□□ -0.71
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PDE4C-211ENST00000597360 CXCL6P80162 114 aa10.59□□□□□ -0.71
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PDE4C-211ENST00000597360 C10orf25Q5T742 122 aa10.58□□□□□ -0.72
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PDE4C-211ENST00000597360 APCP25054 2843 aa10.57□□□□□ -0.72
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PDE4C-211ENST00000597360 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa10.56□□□□□ -0.72
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PDE4C-211ENST00000597360 CD164L2Q6UWJ8 174 aa10.54□□□□□ -0.72
PDE4C-211ENST00000597360 CYSRT1A8MQ03 144 aa10.54□□□□□ -0.72
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PDE4C-211ENST00000597360 SPTSSBQ8NFR3 76 aa10.53□□□□□ -0.72
PDE4C-211ENST00000597360 TEX15Q9BXT5 2789 aa10.52□□□□□ -0.73
PDE4C-211ENST00000597360 MXRA5Q9NR99 2828 aa10.5□□□□□ -0.73
PDE4C-211ENST00000597360 EPM2AB3EWF7 344 aa10.5□□□□□ -0.73
PDE4C-211ENST00000597360 COX17Q14061 63 aa10.5□□□□□ -0.73
PDE4C-211ENST00000597360 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PDE4C-211ENST00000597360 SMIM29Q86T20 159 aa10.49□□□□□ -0.73
PDE4C-211ENST00000597360 Q6YL49 198 aa10.48□□□□□ -0.73
PDE4C-211ENST00000597360 PRO0255Q9UI72 69 aa10.47□□□□□ -0.73
PDE4C-211ENST00000597360 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
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PDE4C-211ENST00000597360 CAMK2N2Q96S95 79 aa10.45□□□□□ -0.74
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PDE4C-211ENST00000597360 IGKV4-1P06312 121 aa10.43□□□□□ -0.74
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PDE4C-211ENST00000597360 UNC79Q9P2D8 2635 aa10.41□□□□□ -0.74
PDE4C-211ENST00000597360 A0A1B0GUV1 79 aa10.41□□□□□ -0.74
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PDE4C-211ENST00000597360 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PDE4C-211ENST00000597360 OCR1Q9BZK8 76 aa10.39□□□□□ -0.75
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PDE4C-211ENST00000597360 DEFB135Q30KP9 77 aa10.38□□□□□ -0.75
PDE4C-211ENST00000597360 DEFB113Q30KQ7 82 aa10.38□□□□□ -0.75
PDE4C-211ENST00000597360 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
PDE4C-211ENST00000597360 DSCR9P59020 149 aa10.37□□□□□ -0.75
PDE4C-211ENST00000597360 Q6ZTC4 211 aa10.37□□□□□ -0.75
PDE4C-211ENST00000597360 NKAPP1Q8N9T2 125 aa10.37□□□□□ -0.75
PDE4C-211ENST00000597360 TRAV22A0A0B4J277 110 aa10.35□□□□□ -0.75
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