RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592597.1

POLR2E-210, Transcript of RNA polymerase II subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene POLR2E, Length 440 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2E-210ENST00000592597 HERV-K104P63124 156 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR2E-210ENST00000592597 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.65□□□□□ -0.86
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POLR2E-210ENST00000592597 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 C14orf177Q52M58 125 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 DPH3Q96FX2 82 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 USP17L23D6RBM5 183 aa9.63□□□□□ -0.87
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POLR2E-210ENST00000592597 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
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POLR2E-210ENST00000592597 IFITM1P13164 125 aa9.61□□□□□ -0.87
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POLR2E-210ENST00000592597 CFAP161Q6P656 301 aa9.55□□□□□ -0.88
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POLR2E-210ENST00000592597 A0A0B4J2C4 111 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
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POLR2E-210ENST00000592597 CFC1P0CG37 223 aa9.5□□□□□ -0.89
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POLR2E-210ENST00000592597 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.49□□□□□ -0.89
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POLR2E-210ENST00000592597 FSIP2Q5CZC0 6907 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 F8WDY8 70 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 PFN2P35080 140 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.41□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 H7C2G1 150 aa9.41□□□□□ -0.9
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