RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592597.1

POLR2E-210, Transcript of RNA polymerase II subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene POLR2E, Length 440 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2E-210ENST00000592597 HERV-K104P63124 156 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR2E-210ENST00000592597 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR2E-210ENST00000592597 C9orf118A6NHY6 69 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 C14orf177Q52M58 125 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 DPH3Q96FX2 82 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 USP17L23D6RBM5 183 aa9.63□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 VAMP3Q15836 100 aa9.63□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.63□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 A0A087WZ39 114 aa9.61□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 CHTF8P0CG12 524 aa9.61□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 IFITM1P13164 125 aa9.61□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 COX7B2Q8TF08 81 aa9.61□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.61□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 SPANXCQ9NY87 97 aa9.61□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 RAB37Q96AX2 223 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 A0A087WYN8 130 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 A0A1B0GWB2 263 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 PRSS2P07478 247 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR2E-210ENST00000592597 FABP2P12104 132 aa9.58□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 XCL1P47992 114 aa9.58□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 GAGE12HA6NDE8 117 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 H3BUT2 72 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 COX7A2LO14548 114 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 APOMO95445 188 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 MALP21145 153 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 FOXI1Q12951 378 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 UBE2V1Q13404 147 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 C5orf38Q86SI9 138 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 A0A1W2PPM0 123 aa9.55□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 GAGE10A6NGK3 116 aa9.55□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 K7ERJ3 54 aa9.55□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 CXCL5P42830 114 aa9.55□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.55□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 CFAP161Q6P656 301 aa9.55□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 A0A0B4J2C4 111 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 Q8IZM0 81 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 LITAFQ99732 161 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 A4D1N5 150 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR2E-210ENST00000592597 CKS1BP61024 79 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 C7orf33Q8WU49 177 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 SPCS1Q9Y6A9 102 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 K7EP34 96 aa9.51□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 C15orf56Q8N910 161 aa9.51□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.51□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 A0A0U1RQV1 116 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 CFC1BP0CG36 223 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 CFC1P0CG37 223 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 REG3GQ6UW15 175 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 ERG28Q9UKR5 140 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 LINC00158P58513 81 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 SLPIP03973 132 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 Q1RN00 199 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
POLR2E-210ENST00000592597 TSPAN13O95857 204 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 PSMB2P49721 201 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 COX17Q14061 63 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 A0A0U1RRA0 63 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 SCGB1C2P0DMR2 95 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 NPC2P61916 151 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 COX6CP09669 75 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 SPAG11BQ08648 103 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 DAND5Q8N907 189 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 C2orf48Q96LS8 159 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 FSIP2Q5CZC0 6907 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 F8WDY8 70 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 PFN2P35080 140 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.41□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 H7C2G1 150 aa9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms