RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRM-214ENST00000583153 TSPAN13O95857 204 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRM-214ENST00000583153 MALP21145 153 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRM-214ENST00000583153 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRM-214ENST00000583153 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRM-214ENST00000583153 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRM-214ENST00000583153 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRM-214ENST00000583153 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRM-214ENST00000583153 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRM-214ENST00000583153 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 PANO1I0J062 215 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 APOMO95445 188 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 CHTF8P0CG12 524 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 COX6A2Q02221 97 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 A0A087WYN8 130 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 Q6ZUT4 128 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 ERG28Q9UKR5 140 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 COX7A2LO14548 114 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 SPINK8P0C7L1 97 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 SYCNQ0VAF6 134 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 C5orf38Q86SI9 138 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 TEN1Q86WV5 123 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 CARD19Q96LW7 228 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 GHRHP01286 108 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 Q6Q795 121 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 HERVK_113P61574 105 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 C7orf33Q8WU49 177 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM141Q96I45 108 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 A0A096LNI7 61 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF815PA8K554 130 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 MT-ATP8P03928 68 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 PSMB2P49721 201 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 GAGE2BQ13066 116 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-214ENST00000583153 IGIPA6NJ69 53 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 C11orf86A6NJI1 115 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 CFC1BP0CG36 223 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 CFC1P0CG37 223 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 SPAG11BQ08648 103 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 Q6ZRU5 148 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 TIMM17AQ99595 171 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 TCL1BO95988 128 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 PMVKQ15126 192 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 C2orf48Q96LS8 159 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0B4J2C4 111 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 OXTP01178 125 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 FAM104AQ969W3 186 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 AMELXQ99217 191 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0J9YXV3 536 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFA1O15239 70 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 LEPROTO15243 131 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A20O43772 301 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 A0A087WZ39 114 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 F8WDY8 70 aa5.22□□□□□ -1.57
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