RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560673.1

KNSTRN-211, Transcript of kinetochore localized astrin (SPAG5) binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene KNSTRN, Length 623 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRN-211ENST00000560673 TIMM17BO60830 172 aa7.19□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.18□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.18□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.18□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 NDUFA1O15239 70 aa7.18□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.18□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.18□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 SPANXCQ9NY87 97 aa7.18□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 GAGE6Q13070 117 aa7.17□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 Q8N3U1 123 aa7.17□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 COPS9Q8WXC6 57 aa7.17□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 A0A0B4J2C4 111 aa7.16□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 APOMO95445 188 aa7.16□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 IFITM1P13164 125 aa7.16□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 COX6A2Q02221 97 aa7.16□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 C7orf33Q8WU49 177 aa7.16□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.16□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 A4D1N5 150 aa7.15□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.15□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 CFC1BP0CG36 223 aa7.15□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 CFC1P0CG37 223 aa7.15□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 HERV-K104P63124 156 aa7.15□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 MIAQ16674 131 aa7.15□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.15□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 DPH3Q96FX2 82 aa7.15□□□□□ -1.26
KNSTRN-211ENST00000560673 A0A1B0GUV1 79 aa7.14□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 TSPAN13O95857 204 aa7.14□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 GHRHP01286 108 aa7.14□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 PRSS2P07478 247 aa7.14□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.14□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.14□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 LITAFQ99732 161 aa7.14□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.13□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 F8W1H4 67 aa7.13□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 ERG28Q9UKR5 140 aa7.13□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.12□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.12□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 TMEM262E9PQX1 116 aa7.12□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 K7ERU9 68 aa7.12□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 SFTA2Q6UW10 78 aa7.12□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.12□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 A0A087WYN8 130 aa7.11□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.11□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 SS18Q15532 418 aa7.11□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 PRR4Q16378 134 aa7.11□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.11□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.11□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.11□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.11□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 A0A087WZ39 114 aa7.1□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.1□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 RBX1P62877 108 aa7.1□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.1□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 COX7B2Q8TF08 81 aa7.1□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.09□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.09□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.09□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 PSMB2P49721 201 aa7.09□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.09□□□□□ -1.27
KNSTRN-211ENST00000560673 H3BMG7 143 aa7.08□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 Q1RN00 199 aa7.08□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 UBE2WQ96B02 151 aa7.08□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.07□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 USP17L23D6RBM5 183 aa7.07□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.07□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 KLK12Q9UKR0 248 aa7.07□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 COX6CP09669 75 aa7.06□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.06□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.06□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 J3QR89 54 aa7.05□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 C5orf38Q86SI9 138 aa7.05□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.05□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.05□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.05□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.04□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 H7C2G1 150 aa7.04□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 TCL1BO95988 128 aa7.04□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 CHTF8P0CG12 524 aa7.04□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 XCL1P47992 114 aa7.04□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 NPC2P61916 151 aa7.04□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 ATXN8Q156A1 80 aa7.04□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.04□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.04□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 Q8IZM0 81 aa7.04□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.04□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 PRO0461Q9UI25 63 aa7.04□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.04□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 COX7A2LO14548 114 aa7.03□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 CXCL5P42830 114 aa7.03□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 REG3AQ06141 175 aa7.03□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.03□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 DAND5Q8N907 189 aa7.03□□□□□ -1.28
KNSTRN-211ENST00000560673 M0QXV9 152 aa7.02□□□□□ -1.29
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