RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558843.5

COPS2-205, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, human

TSL 1 (best)

Gene COPS2, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS2-205	ENST00000558843	ST20	Q9HBF5	79 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	CRIPT	Q9P021	101 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	IGF2R	P11717	2491 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	AKAP6	Q13023	2319 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	SAMD9	Q5K651	1589 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	PIEZO1	Q92508	2521 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	ATP7B	P35670	1465 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	ERVK-7	P63135	1459 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843		A0A087WXM4	84 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843		I3L3M4	83 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	COX6B1	P14854	86 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	PIK3C2B	O00750	1634 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	SPTA1	P02549	2419 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	ANK2	Q01484	3957 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843		H3BUT2	72 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	CCL22	O00626	93 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	SPINK1	P00995	79 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	IGLC2	P0DOY2	106 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	IGLC3	P0DOY3	106 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843		Q5BKY6	102 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	GAFA1	Q96PS6	74 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	NCOR1	O75376	2440 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	SLIT1	O75093	1534 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	MAP3K1	Q13233	1512 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	0.23	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	CLIP1	P30622	1438 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	POLQ	O75417	2590 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843		I3L2K1	104 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	SPINK4	O60575	86 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	SMIM13	P0DJ93	91 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	COX7B	P24311	80 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843		Q5VSD8	79 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	DEFB123	Q8N688	67 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	PTPN13	Q12923	2485 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843	NES	P48681	1621 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843	ABCA8	O94911	1581 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843	NWD1	Q149M9	1564 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843	UMAD1	C9J7I0	102 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843		K7EQZ3	153 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	0.21	□□□□□ -2.38	2e-6	■■■■□ 24.4
COPS2-205	ENST00000558843	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843	NCOA2	Q15596	1464 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843	HFM1	A2PYH4	1435 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		0.2	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
COPS2-205	ENST00000558843	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		0.2	□□□□□ -2.38

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