RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa0.55□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 SPRR1AP35321 89 aa0.55□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 Q5VSD8 79 aa0.55□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 KIAA0556O60303 1618 aa0.55□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 CELSR2Q9HCU4 2923 aa0.55□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 MAGI2Q86UL8 1455 aa0.54□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 KIF14Q15058 1648 aa0.54□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 ALKQ9UM73 1620 aa0.54□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa0.54□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 C5P01031 1676 aa0.54□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 SPRR1BP22528 89 aa0.54□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 C18orf32Q8TCD1 76 aa0.54□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 U3KQA8 63 aa0.54□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 TNCP24821 2201 aa0.54□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 ERVK-7P63135 1459 aa0.54□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 LRRC7Q96NW7 1537 aa0.54□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 UBR1Q8IWV7 1749 aa0.53□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa0.53□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 NREPQ16612 68 aa0.53□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 KLK9Q2XQG4 91 aa0.53□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 ANKARQ7Z5J8 1434 aa0.53□□□□□ -2.32
TMOD3-202ENST00000558300 ATP7BP35670 1465 aa0.53□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa0.53□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa0.53□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 ABCC1P33527 1531 aa0.53□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 USP24Q9UPU5 2620 aa0.52□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 PPLO60437 1756 aa0.52□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF292O60281 2723 aa0.52□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 IFI6P09912 130 aa0.52□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 SLIT1O75093 1534 aa0.52□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 LRRC37AA6NMS7 1700 aa0.52□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 AKAP6Q13023 2319 aa0.52□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 CSMD3Q7Z407 3707 aa0.51□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 ATXN8Q156A1 80 aa0.51□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.51□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa0.51□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa0.51□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 NCOA2Q15596 1464 aa0.5□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 H0YGG7 62 aa0.5□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 NDUFA4O00483 81 aa0.5□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa0.5□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 UBL5Q9BZL1 73 aa0.5□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.5□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 USF3Q68DE3 2245 aa0.5□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 GPR98Q8WXG9 6306 aa0.5□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa0.49□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa0.49□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 URB1O60287 2271 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 KDM5DQ9BY66 1539 aa0.48□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 C3orf79P0CE67 100 aa0.48□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 DEFB121Q5J5C9 76 aa0.48□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 COX6B2Q6YFQ2 88 aa0.48□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 WFDC13Q8IUB5 93 aa0.48□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 PRO3102Q9H379 93 aa0.48□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 HILPDAQ9Y5L2 63 aa0.48□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 MYH4Q9Y623 1939 aa0.48□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa0.47□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 NDUFA3O95167 84 aa0.47□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 LINC00158P58513 81 aa0.47□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 ENHOQ6UWT2 76 aa0.47□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 S100ZQ8WXG8 99 aa0.47□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP0.47□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 DUOX2Q9NRD8 1548 aa0.47□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 HFM1A2PYH4 1435 aa0.47□□□□□ -2.33
TMOD3-202ENST00000558300 IGF2RP11717 2491 aa0.46□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 PKDREJQ9NTG1 2253 aa0.46□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa0.46□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 SMIM5Q71RC9 77 aa0.45□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 RALGAPBQ86X10 1494 aa0.45□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 UBR3Q6ZT12 1888 aa0.45□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 UNC79Q9P2D8 2635 aa0.45□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 NCOR1O75376 2440 aa0.44□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa0.44□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 PKD1L3Q7Z443 1732 aa0.44□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 MAP3K1Q13233 1512 aa0.43□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 DEFB135Q30KP9 77 aa0.43□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa0.43□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa0.43□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 PTPN13Q12923 2485 aa0.42□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 DIP2BQ9P265 1576 aa0.42□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 M0R2T5 61 aa0.42□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 FCER1GP30273 86 aa0.42□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 LMTK2Q8IWU2 1503 aa0.42□□□□□ -2.34
TMOD3-202ENST00000558300 UGGT2Q9NYU1 1516 aa0.42□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms