RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 TOMM6Q96B49 74 aa5.16□□□□□ -1.58
TROAP-208ENST00000548817 TMEM141Q96I45 108 aa5.16□□□□□ -1.58
TROAP-208ENST00000548817 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.16□□□□□ -1.58
TROAP-208ENST00000548817 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
TROAP-208ENST00000548817 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.15□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 GAGE10A6NGK3 116 aa5.15□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 C9orf118A6NHY6 69 aa5.15□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 F8VRH5 84 aa5.15□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 TAX1BP3O14907 124 aa5.15□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 UBE2D1P51668 147 aa5.15□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 UBE2BP63146 152 aa5.15□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 PRR4Q16378 134 aa5.15□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.15□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 Q6ZUT4 128 aa5.15□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.15□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.15□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.14□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 A6NJY4 79 aa5.14□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 H0Y9J4 135 aa5.14□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 GAGE2EQ4V326 116 aa5.14□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.14□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.14□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.14□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.14□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 K7ERU9 68 aa5.13□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 FABP2P12104 132 aa5.13□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.13□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 FAM168BA1KXE4 195 aa5.12□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.12□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.12□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.12□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 TIMM17AQ99595 171 aa5.12□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 MUC17Q685J3 4493 aa5.12□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.11□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.11□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 M0QXV9 152 aa5.11□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 C10orf25Q5T742 122 aa5.11□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 CEND1Q8N111 149 aa5.11□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 HIST1H4GQ99525 98 aa5.11□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.11□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.1□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 E9PLD3 99 aa5.1□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 J3QR89 54 aa5.1□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 PMVKQ15126 192 aa5.1□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 A0A1W2PPM0 123 aa5.09□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.09□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 K7EP34 96 aa5.09□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 PRSS2P07478 247 aa5.09□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 PCP2Q8IVA1 136 aa5.09□□□□□ -1.59
TROAP-208ENST00000548817 C11orf86A6NJI1 115 aa5.08□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 H3BUT2 72 aa5.08□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 CKS1BP61024 79 aa5.08□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.08□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.08□□□□□ -1.6
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TROAP-208ENST00000548817 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.07□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 C2orf82Q6UX34 121 aa5.07□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.07□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.07□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 CST9LQ9H4G1 147 aa5.07□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.07□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.07□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 IGIPA6NJ69 53 aa5.06□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 ZNF815PA8K554 130 aa5.06□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 F8W1H4 67 aa5.06□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 TSPAN13O95857 204 aa5.06□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.06□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.06□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.06□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 FAM104AQ969W3 186 aa5.06□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 RAB37Q96AX2 223 aa5.06□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 VCX2Q9H322 139 aa5.06□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.05□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.05□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 A0A1B0GWB2 263 aa5.05□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.05□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 VPS25Q9BRG1 176 aa5.05□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.05□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 C22orf24Q9Y442 160 aa5.05□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 LEPROTO15243 131 aa5.04□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 FXYD2P54710 66 aa5.04□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.04□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 Q6ZVH6 145 aa5.04□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.03□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 CRYGAP11844 174 aa5.03□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
TROAP-208ENST00000548817 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.03□□□□□ -1.6
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