RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1B0GUV1 79 aa3.85□□□□□ -1.79
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGIPA6NJ69 53 aa3.85□□□□□ -1.79
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGKCP01834 107 aa3.85□□□□□ -1.79
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLNP26678 52 aa3.85□□□□□ -1.79
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LINC01545Q5VT33 79 aa3.85□□□□□ -1.79
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C2orf91Q6ZV80 131 aa3.85□□□□□ -1.79
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COPS9Q8WXC6 57 aa3.85□□□□□ -1.79
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL7A1Q02388 2944 aa3.85□□□□□ -1.79
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HERVK_113P61574 105 aa3.84□□□□□ -1.79
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SS18Q15532 418 aa3.84□□□□□ -1.79
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CEND1Q8N111 149 aa3.84□□□□□ -1.79
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.84□□□□□ -1.79
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHV3-33P01772 117 aa3.83□□□□□ -1.8
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa3.83□□□□□ -1.8
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.83□□□□□ -1.8
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPC2P61916 151 aa3.83□□□□□ -1.8
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C6orf223Q8N319 242 aa3.83□□□□□ -1.8
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H0Y9J4 135 aa3.8□□□□□ -1.8
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLPSL2Q6UWE3 100 aa3.8□□□□□ -1.8
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.79□□□□□ -1.8
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LCA10Q71F78 164 aa3.79□□□□□ -1.8
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 XCL1P47992 114 aa3.78□□□□□ -1.8
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.78□□□□□ -1.8
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa3.78□□□□□ -1.8
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.78□□□□□ -1.8
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM223A0PJW6 202 aa3.78□□□□□ -1.8
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa3.78□□□□□ -1.8
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LEPROTO15243 131 aa3.78□□□□□ -1.8
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM104AQ969W3 186 aa3.78□□□□□ -1.8
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRR34Q9NV39 138 aa3.78□□□□□ -1.8
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.78□□□□□ -1.8
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PSCAO43653 123 aa3.77□□□□□ -1.81
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.77□□□□□ -1.81
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MP68P56378 58 aa3.77□□□□□ -1.81
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COX6A2Q02221 97 aa3.77□□□□□ -1.81
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ENHOQ6UWT2 76 aa3.77□□□□□ -1.81
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.77□□□□□ -1.81
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