RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 G0S2P27469 103 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00483Q53H64 154 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRU-209ENST00000526080 ERG28Q9UKR5 140 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRU-209ENST00000526080 USH2AO75445 5202 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRU-209ENST00000526080 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRU-209ENST00000526080 CST9LQ9H4G1 147 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRU-209ENST00000526080 RAB14P61106 215 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRU-209ENST00000526080 COX17Q14061 63 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRU-209ENST00000526080 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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PTPRU-209ENST00000526080 PEA15Q15121 130 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRU-209ENST00000526080 AKAP14Q86UN6 197 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPRU-209ENST00000526080 H3BRM9 83 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRU-209ENST00000526080 SLC25A20O43772 301 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRU-209ENST00000526080 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRU-209ENST00000526080 LINC01546A6NGU7 62 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRU-209ENST00000526080 PMVKQ15126 192 aa7.53□□□□□ -1.2
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PTPRU-209ENST00000526080 PCOTHQ58A44 107 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRU-209ENST00000526080 LINC01549A6NIU2 74 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRU-209ENST00000526080 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRU-209ENST00000526080 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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PTPRU-209ENST00000526080 SFTA2Q6UW10 78 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRU-209ENST00000526080 B5MCH6 92 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRU-209ENST00000526080 M0R2T5 61 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRU-209ENST00000526080 NCR3O14931 201 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00158P58513 81 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRU-209ENST00000526080 Q9BRP9 147 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRU-209ENST00000526080 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
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PTPRU-209ENST00000526080 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.41□□□□□ -1.22
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PTPRU-209ENST00000526080 C9orf92A6NGG3 77 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRU-209ENST00000526080 SMIM13P0DJ93 91 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRU-209ENST00000526080 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRU-209ENST00000526080 IGLV6-57P01721 117 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRU-209ENST00000526080 BAGE3Q86Y29 109 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRU-209ENST00000526080 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRU-209ENST00000526080 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRU-209ENST00000526080 ATP6V1G1O75348 118 aa7.31□□□□□ -1.24
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PTPRU-209ENST00000526080 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.31□□□□□ -1.24
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PTPRU-209ENST00000526080 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRU-209ENST00000526080 HERV-K104P63124 156 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRU-209ENST00000526080 PMCHL1Q16048 86 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRU-209ENST00000526080 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRU-209ENST00000526080 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00587B1AMM8 73 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRU-209ENST00000526080 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRU-209ENST00000526080 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRU-209ENST00000526080 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRU-209ENST00000526080 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRU-209ENST00000526080 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRU-209ENST00000526080 S100PP25815 95 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRU-209ENST00000526080 CD164Q04900 197 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRU-209ENST00000526080 Q5XG85 94 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRU-209ENST00000526080 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.22□□□□□ -1.25
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