RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 NPC2P61916 151 aa6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 WFDC2Q14508 124 aa6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 CARD19Q96LW7 228 aa6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 A4D1N5 150 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 SLPIP03973 132 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 A0A087WTM6 91 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 LCE6AA0A183 80 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 A0A1B0GWB2 263 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 UBE2V1Q13404 147 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-210ENST00000519815 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 CFC1BP0CG36 223 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 CFC1P0CG37 223 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 Q8N814 137 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 A0A0B4J2C4 111 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 K7ERJ3 54 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 RAB37Q96AX2 223 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 NDUFC2O95298 119 aa6.75□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 GAGE2EQ4V326 116 aa6.75□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 Q6ZRP5 223 aa6.75□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.75□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.75□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.75□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.75□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 TAX1BP3O14907 124 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 TRIAP1O43715 76 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 RTL8CO15255 209 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 GAGE2BQ13066 116 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 LYSTQ99698 3801 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-210ENST00000519815 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 IGKV2D-28P01615 120 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 C16orf90A8MZG2 172 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 H3BUT2 72 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 H7C2G1 150 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 NCR3O14931 201 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 TSPAN13O95857 204 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 VPREB1P12018 145 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 Q1RN00 199 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 Q8NDZ9 215 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 A0A096LNI7 61 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 M0R378 163 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM126AQ9H061 195 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 PSMB2P49721 201 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 LINC01620Q4KN68 170 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 A0A1W2PPM0 123 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 LCE1DQ5T752 114 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 FAM168BA1KXE4 195 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 K7ERU9 68 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 COX6CP09669 75 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 FABP2P12104 132 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 VPS25Q9BRG1 176 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-210ENST00000519815 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-210ENST00000519815 IGLV6-57P01721 117 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-210ENST00000519815 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-210ENST00000519815 VAMP3Q15836 100 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-210ENST00000519815 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-210ENST00000519815 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-210ENST00000519815 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-210ENST00000519815 DPH3Q96FX2 82 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-210ENST00000519815 C22orf24Q9Y442 160 aa6.64□□□□□ -1.35
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