RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519813.1

TMPRSS4-208, Transcript of transmembrane serine protease 4, human

TSL 5

Gene TMPRSS4, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMPRSS4-208	ENST00000519813	PDZD2	O15018	2839 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	COX7B	P24311	80 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	ESRG	Q1W209	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	ACAN	P16112	2415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813		Q6ZTC4	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	VPS13C	Q709C8	3753 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	ZAN	Q9Y493	2812 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	NCR3	O14931	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	VPREB1	P12018	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	COX7C	P15954	63 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	CXCL6	P80162	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813		Q6ZQT0	140 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMPRSS4-208	ENST00000519813	SLPI	P03973	132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	CRYGA	P11844	174 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813		Q6ZQY7	126 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813		Q6ZRU5	148 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813		Q8N3U1	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813		B5MCH6	92 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	MTOR	P42345	2549 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	NOTCH2	Q04721	2471 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	PRY	O14603	147 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813		Q6ZRP5	223 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813		Q8NDZ9	215 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	SPRR1A	P35321	89 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	RETN	Q9HD89	108 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TMPRSS4-208	ENST00000519813	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813		Q6ZVQ6	151 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813		Q6ZRX8	168 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813	CENPE	Q02224	2701 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813	TMEM258	P61165	79 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813	NREP	Q16612	68 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TMPRSS4-208	ENST00000519813	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65

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