RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa5.53□□□□□ -1.52
TRPS1-208ENST00000519076 DNAL4O96015 105 aa5.53□□□□□ -1.52
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.52□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.52□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.52□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.52□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 F8WEM9 126 aa5.52□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.51□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00158P58513 81 aa5.51□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.51□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 AMELXQ99217 191 aa5.51□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa5.51□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.51□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 LYRM9A8MSI8 78 aa5.5□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.5□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 OVOL2Q9BRP0 275 aa5.5□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0J9YXY3 114 aa5.5□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.49□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 COX6A2Q02221 97 aa5.49□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.49□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 C8orf87E5RJ46 101 aa5.49□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 MIFP14174 115 aa5.49□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.49□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.49□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.49□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFS5O43920 106 aa5.49□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 ESRGQ1W209 222 aa5.49□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 X6R8D5 127 aa5.49□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 M0R378 163 aa5.48□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 CRPP02741 224 aa5.48□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.48□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.48□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.48□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00846Q9NV44 126 aa5.48□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 COX7A2LO14548 114 aa5.47□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 KLK12Q9UKR0 248 aa5.47□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 CELA1Q9UNI1 258 aa5.47□□□□□ -1.53
TRPS1-208ENST00000519076 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.46□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.46□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 RMI2Q96E14 147 aa5.46□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 SNURFQ9Y675 71 aa5.46□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 WFDC9Q8NEX5 89 aa5.45□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 COX7B2Q8TF08 81 aa5.45□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.45□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.45□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.45□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.44□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 REG3AQ06141 175 aa5.44□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 MIAQ16674 131 aa5.44□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 Q1T7F1 81 aa5.44□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.44□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 C22orf24Q9Y442 160 aa5.44□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.43□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZVQ6 151 aa5.43□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 A0A087WZ39 114 aa5.43□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFA1O15239 70 aa5.43□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 UBE2BP63146 152 aa5.43□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0J9YWU9 116 aa5.42□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZTC4 211 aa5.42□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 Q8N3U1 123 aa5.42□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 Q8NAQ8 132 aa5.42□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 Q9HAA7 133 aa5.42□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa5.41□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.41□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.41□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.41□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 LITAFQ99732 161 aa5.41□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP10-11P60412 298 aa5.4□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 ENHOQ6UWT2 76 aa5.4□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 FAM104AQ969W3 186 aa5.4□□□□□ -1.54
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.4□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.4□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.39□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 LELP1Q5T871 98 aa5.39□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.38□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 SPAG11BQ08648 103 aa5.38□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.38□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 LCA10Q71F78 164 aa5.38□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1B0GUV1 79 aa5.38□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.37□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.37□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.37□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.37□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 A8MUN3 132 aa5.36□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.36□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.36□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 UBL5Q9BZL1 73 aa5.36□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 ERC2-IT1O76042 136 aa5.36□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZRP5 223 aa5.36□□□□□ -1.55
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