RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	APC	P25054	2843 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	OXT	P01178	125 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	XCL1	P47992	114 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	COX17	Q14061	63 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	BCE1	O60756	84 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	HILS1	P60008	231 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00575	Q6W349	94 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	DPH3	Q96FX2	82 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	MTOR	P42345	2549 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	EPM2A	B3EWF7	344 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	IGLV6-57	P01721	117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6ZQT0	140 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	C6orf223	Q8N319	242 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC01006	Q8NI28	216 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	MUC7	Q8TAX7	377 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A0J9YWU9	116 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	DEFB130B	P0DP73	79 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	DEFB130A	P0DP74	79 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	C5orf47	Q569G3	176 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	PRO0255	Q9UI72	69 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	LYRM9	A8MSI8	78 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	C6orf99	Q4VX62	202 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	C10orf25	Q5T742	122 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	ENHO	Q6UWT2	76 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746		H3BQ85	93 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746		M0R2N4	97 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	PRB1	P04280	392 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	PDE6G	P18545	87 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	KRTAP10-3	P60369	221 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746		Q5XG85	94 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	DSCR8	Q96T75	97 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	UBL5	Q9BZL1	73 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	VWF	P04275	2813 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-212	ENST00000515746	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	CXCL6	P80162	114 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	REG3A	Q06141	175 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	SPAG11B	Q08648	103 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6ZVQ6	151 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF843	Q8N446	348 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	PRR34	Q9NV39	138 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	ACAN	P16112	2415 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	HIVEP2	P31629	2446 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	PDZD2	O15018	2839 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A096LPF7	62 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746		H7BZZ5	65 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	TENM4	Q6N022	2769 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM236C	P0DP71	79 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	KLKP1	Q107X0	134 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	LELP1	Q5T871	98 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6ZQY7	126 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	C20orf197	Q8N268	126 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746		Q8NAQ8	132 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ATXN3-212	ENST00000515746	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		3.31	□□□□□ -1.88

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