RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511313.5

POLR2J3-215, Transcript of RNA polymerase II subunit J3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POLR2J3, Length 4,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J3-215ENST00000511313 Q6ZR54 194 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 CEND1Q8N111 149 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 A0A087WYN8 130 aa6.44□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 J3KT08 172 aa6.44□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.44□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 FRYQ5TBA9 3013 aa6.43□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 Q8NBF4 154 aa6.42□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.42□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 LST1O00453 97 aa6.41□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 A0A1B0GW54 56 aa6.41□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 SIGMAR1Q99720 223 aa6.41□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.41□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 IGKV2D-28P01615 120 aa6.41□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 MUC4Q99102 2169 aa6.41□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 DAND5Q8N907 189 aa6.41□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.41□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF861PO60384 105 aa6.4□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
POLR2J3-215ENST00000511313 COL6A5A8TX70 2615 aa6.4□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.4□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 MTURNQ8N3F0 131 aa6.4□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 NREPQ16612 68 aa6.39□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 AKAP13Q12802 2813 aa6.39□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 STAB1Q9NY15 2570 aa6.39□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.38□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 ACYP1P07311 99 aa6.38□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 C6orf99Q4VX62 202 aa6.38□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 IGLV7-43P04211 117 aa6.37□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.37□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 LINC00167Q96N53 147 aa6.37□□□□□ -1.39
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POLR2J3-215ENST00000511313 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.37□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 H3BT86 120 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 K7ERU9 68 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 A0A096LNI7 61 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 H3BMG7 143 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 PCP2Q8IVA1 136 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 Q9BRP9 147 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR2J3-215ENST00000511313 C5orf47Q569G3 176 aa6.34□□□□□ -1.4
POLR2J3-215ENST00000511313 NDUFS5O43920 106 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR2J3-215ENST00000511313 H3BUT2 72 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR2J3-215ENST00000511313 Q5VSD8 79 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR2J3-215ENST00000511313 PRR4Q16378 134 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR2J3-215ENST00000511313 H0Y9J4 135 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR2J3-215ENST00000511313 C15orf56Q8N910 161 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR2J3-215ENST00000511313 SPINK1P00995 79 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR2J3-215ENST00000511313 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
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POLR2J3-215ENST00000511313 SEC61GP60059 68 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR2J3-215ENST00000511313 MGAQ8IWI9 3026 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR2J3-215ENST00000511313 CDIP1Q9H305 208 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR2J3-215ENST00000511313 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR2J3-215ENST00000511313 UBE2V1Q13404 147 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR2J3-215ENST00000511313 Q8N1X5 172 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR2J3-215ENST00000511313 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR2J3-215ENST00000511313 CD164Q04900 197 aa6.28□□□□□ -1.4
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POLR2J3-215ENST00000511313 HIVEP1P15822 2718 aa6.27□□□□□ -1.41
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POLR2J3-215ENST00000511313 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 MP68P56378 58 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 C9orf118A6NHY6 69 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 C8orf87E5RJ46 101 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 HAMPP81172 84 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 TEN1Q86WV5 123 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 FAM236CP0DP71 79 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 F8W1H4 67 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 BPY2O14599 106 aa6.24□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 LINC00310P59036 64 aa6.24□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 ITPR2Q14571 2701 aa6.24□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 VPREB1P12018 145 aa6.24□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 CHTF8P0CG12 524 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 PRLHP81277 87 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 CLEC2BQ92478 149 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 ZZEF1O43149 2961 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR2J3-215ENST00000511313 GAS8-AS1O95177 125 aa6.22□□□□□ -1.41
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