RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-0.01□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 CEP162Q5TB80 1403 aa-0.01□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 LOC730098B7Z3J9 87 aa-0.01□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 IGLC2P0DOY2 106 aa-0.01□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 IGLC3P0DOY3 106 aa-0.01□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-0.01□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 ANKRD36A6QL64 1941 aa-0.01□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa-0.01□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-0.02□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 TTC37Q6PGP7 1564 aa-0.02□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-0.02□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 SMIM11AP58511 58 aa-0.02□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 PEA15Q15121 130 aa-0.02□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 V9GYS6 101 aa-0.02□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 ATRQ13535 2644 aa-0.02□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 MYH4Q9Y623 1939 aa-0.03□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 SSPOA2VEC9 5147 aa-0.03□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 DEFB112Q30KQ8 113 aa-0.03□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-0.03□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 NMSQ5H8A3 153 aa-0.03□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
UBE2B-202ENST00000499038 FSIP2Q5CZC0 6907 aa-0.03□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 ALKQ9UM73 1620 aa-0.04□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 K7EP34 96 aa-0.04□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 CCL22O00626 93 aa-0.04□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 PLGLAQ15195 96 aa-0.04□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 PYY3Q5JQD4 70 aa-0.04□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 ABCC3O15438 1527 aa-0.04□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-0.04□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 KIF20BQ96Q89 1820 aa-0.04□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 TNXBP22105 4242 aa-0.04□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-0.04□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 MAGI2Q86UL8 1455 aa-0.04□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-0.04□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 UBR1Q8IWV7 1749 aa-0.04□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 CHD8Q9HCK8 2581 aa-0.04□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 CLIP1P30622 1438 aa-0.04□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa-0.05□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 A0A1B0GUT8 65 aa-0.05□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-0.05□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 IQCF6A8MYZ5 107 aa-0.05□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 M0R2T5 61 aa-0.05□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 ATP7BP35670 1465 aa-0.05□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.05□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 PLIN4Q96Q06 1357 aa-0.06□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 HMCN2Q8NDA2 5059 aa-0.06□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 LRRC7Q96NW7 1537 aa-0.06□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 CYB5AP00167 134 aa-0.06□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 COX7BP24311 80 aa-0.06□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 HEPN1Q6WQI6 88 aa-0.06□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 HSPG2P98160 4391 aa-0.06□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 BCORQ6W2J9 1755 aa-0.06□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 APC2O95996 2303 aa-0.07□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 QSER1Q2KHR3 1735 aa-0.07□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-0.07□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 SPRR2BP35325 72 aa-0.07□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 LELP1Q5T871 98 aa-0.07□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 GAFA1Q96PS6 74 aa-0.07□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-0.07□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 RGPD2P0DJD1 1756 aa-0.07□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 RGPD1P0DJD0 1748 aa-0.07□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-0.08□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 LPAP08519 4548 aa-0.08□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 MYCBP2O75592 4640 aa-0.08□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 GNG2P59768 71 aa-0.08□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 LINC00643Q86TS7 51 aa-0.08□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.08□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 RABAC1Q9UI14 185 aa-0.08□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 SMARCA2P51531 1590 aa-0.08□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 UBR3Q6ZT12 1888 aa-0.08□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-0.08□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 PREX1Q8TCU6 1659 aa-0.08□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-0.09□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 KIF14Q15058 1648 aa-0.09□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-0.09□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-0.09□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 ACYP1P07311 99 aa-0.09□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 WFDC13Q8IUB5 93 aa-0.09□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 WFDC9Q8NEX5 89 aa-0.09□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 PPLO60437 1756 aa-0.09□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-0.09□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 ACANP16112 2415 aa-0.09□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.42
UBE2B-202ENST00000499038 ALMS1Q8TCU4 4167 aa-0.1□□□□□ -2.43
UBE2B-202ENST00000499038 UACAQ9BZF9 1416 aa-0.1□□□□□ -2.43
UBE2B-202ENST00000499038 STAB1Q9NY15 2570 aa-0.1□□□□□ -2.43
UBE2B-202ENST00000499038 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-0.1□□□□□ -2.43
UBE2B-202ENST00000499038 DEFB135Q30KP9 77 aa-0.1□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133 ms