RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.04□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.03□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.03□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.03□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 DNAH2Q9P225 4427 aa7.03□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 TSPAN13O95857 204 aa7.02□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 C14orf177Q52M58 125 aa7.02□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 CARD19Q96LW7 228 aa7.02□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A1B0GVY2 172 aa7.01□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A1W2PPM0 123 aa7.01□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 LECT2O14960 151 aa7.01□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 NDUFC2O95298 119 aa7.01□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 Q6ZR54 194 aa7.01□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.01□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 M0R2N4 97 aa7□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 SLPIP03973 132 aa7□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 FABP2P12104 132 aa7□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 WFDC2Q14508 124 aa7□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 VAMP3Q15836 100 aa7□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.99□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 IGKV2D-28P01615 120 aa6.99□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.99□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 Q1RN00 199 aa6.99□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.98□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 H7C2G1 150 aa6.98□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.97□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.97□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.97□□□□□ -1.29
ECHDC3-204ENST00000495787 GAGE10A6NGK3 116 aa6.96□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 K7EP34 96 aa6.96□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 PSMB2P49721 201 aa6.96□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 Q6ZRP5 223 aa6.96□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.96□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.96□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.96□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 PKD1P98161 4303 aa6.95□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.95□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 UBE2V1Q13404 147 aa6.95□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 GAGE2EQ4V326 116 aa6.95□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.95□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.95□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 HERC1Q15751 4861 aa6.94□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.94□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 TRIAP1O43715 76 aa6.94□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 COX6CP09669 75 aa6.94□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.94□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 Q8NDZ9 215 aa6.94□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.94□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 HSPG2P98160 4391 aa6.93□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 NCR3O14931 201 aa6.93□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 RTL8CO15255 209 aa6.93□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 VPREB1P12018 145 aa6.93□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM126AQ9H061 195 aa6.93□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.92□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A087WTM6 91 aa6.92□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 Q8N814 137 aa6.92□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.92□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.92□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 GAGE2BQ13066 116 aa6.91□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.91□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.91□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 M0R378 163 aa6.9□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 TCL1BO95988 128 aa6.9□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.9□□□□□ -1.3
ECHDC3-204ENST00000495787 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.89□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 C16orf90A8MZG2 172 aa6.89□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 IGLV6-57P01721 117 aa6.89□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 H3BMG7 143 aa6.88□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 ATXN8Q156A1 80 aa6.88□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.88□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A096LNI7 61 aa6.87□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.87□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 H0YGX0 51 aa6.87□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 CDK2AP2O75956 126 aa6.87□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.87□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.87□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.86□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 LST1O00453 97 aa6.86□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.86□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 CLEC2BQ92478 149 aa6.86□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.84□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.84□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM168BA1KXE4 195 aa6.84□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 F8W1H4 67 aa6.84□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 TNP2Q05952 138 aa6.84□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC01620Q4KN68 170 aa6.84□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.84□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 C7orf33Q8WU49 177 aa6.84□□□□□ -1.31
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.7 ms