RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CBX1-205ENST00000495350 C22orf24Q9Y442 160 aa3.54□□□□□ -1.84
CBX1-205ENST00000495350 A0A096LNJ9 63 aa3.53□□□□□ -1.84
CBX1-205ENST00000495350 A0A1B0GV90 55 aa3.53□□□□□ -1.84
CBX1-205ENST00000495350 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.53□□□□□ -1.84
CBX1-205ENST00000495350 HBDP02042 147 aa3.53□□□□□ -1.84
CBX1-205ENST00000495350 PMCHL1Q16048 86 aa3.53□□□□□ -1.84
CBX1-205ENST00000495350 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.53□□□□□ -1.84
CBX1-205ENST00000495350 Q6ZN92 141 aa3.53□□□□□ -1.84
CBX1-205ENST00000495350 ERASQ7Z444 233 aa3.53□□□□□ -1.84
CBX1-205ENST00000495350 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
CBX1-205ENST00000495350 TMEM141Q96I45 108 aa3.53□□□□□ -1.84
CBX1-205ENST00000495350 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3.53□□□□□ -1.84
CBX1-205ENST00000495350 TIMM17AQ99595 171 aa3.53□□□□□ -1.84
CBX1-205ENST00000495350 VCX2Q9H322 139 aa3.53□□□□□ -1.84
CBX1-205ENST00000495350 MUC17Q685J3 4493 aa3.52□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 HSBP1O75506 76 aa3.52□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 PRSS2P07478 247 aa3.52□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 KRTDAPP60985 99 aa3.52□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa3.52□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.52□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 C2orf82Q6UX34 121 aa3.52□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 AMELXQ99217 191 aa3.52□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 VAMP8Q9BV40 100 aa3.52□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 TP73-AS1Q9UF72 201 aa3.52□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 ATP5LO75964 103 aa3.51□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 C3orf79P0CE67 100 aa3.51□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 CKS1BP61024 79 aa3.51□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 PMVKQ15126 192 aa3.51□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 C4orf48Q5BLP8 95 aa3.51□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.51□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.51□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.51□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.51□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.51□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.5□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 M0R143 59 aa3.5□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 KIAA0087Q14695 138 aa3.5□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.5□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa3.5□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 FAM19A2Q8N3H0 131 aa3.5□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.5□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.5□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 CST9LQ9H4G1 147 aa3.5□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.5□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 GAGE10A6NGK3 116 aa3.49□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 LEPROTL1O95214 131 aa3.49□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 HERVK_113P63121 156 aa3.49□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 SEC11AP67812 179 aa3.49□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 SPATA45Q537H7 98 aa3.49□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.49□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 DAND5Q8N907 189 aa3.49□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.49□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.49□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa3.48□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa3.48□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 IGLC3P0DOY3 106 aa3.48□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 LINC01561Q8N1V8 128 aa3.48□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 LINC00167Q96N53 147 aa3.48□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 UQCR10Q9UDW1 63 aa3.48□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.48□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 C20orf202A1L168 122 aa3.47□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 M0R2T5 61 aa3.47□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 MT1HP80294 61 aa3.47□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.47□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.47□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 ATOH7Q8N100 152 aa3.47□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.47□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.47□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CBX1-205ENST00000495350 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.46□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 F8VRH5 84 aa3.46□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 H0Y8G0 127 aa3.46□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 PRLHP81277 87 aa3.46□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 Q8IZM0 81 aa3.46□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.46□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 C11orf86A6NJI1 115 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 H3BRM9 83 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 DLEU1O43261 78 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 IGKV2D-28P01615 120 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 SPINK8P0C7L1 97 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 CXCL5P42830 114 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 BATFQ16520 125 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 LCE2CQ5TA81 110 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 PET117Q6UWS5 81 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 SPINK1P00995 79 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 TMEM170BQ5T4T1 132 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 LINC01545Q5VT33 79 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 Q8NBF4 154 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 COX7B2Q8TF08 81 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms