RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 Q9UF83 564 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-213ENST00000489895 ACANP16112 2415 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-213ENST00000489895 A0A1B0GW54 56 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-213ENST00000489895 EPG5Q9HCE0 2579 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-213ENST00000489895 LINC00588Q9Y4M8 146 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-213ENST00000489895 SMIM26A0A096LP01 95 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-213ENST00000489895 KIAA0087Q14695 138 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-213ENST00000489895 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-213ENST00000489895 HCG22E2RYF7 251 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-213ENST00000489895 MUC4Q99102 2169 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-213ENST00000489895 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-213ENST00000489895 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-213ENST00000489895 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-213ENST00000489895 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-213ENST00000489895 C16orf90A8MZG2 172 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-213ENST00000489895 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-213ENST00000489895 SVIPQ8NHG7 77 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-213ENST00000489895 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-213ENST00000489895 A6NED7 52 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-213ENST00000489895 SPATA3Q8NHX4 192 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-213ENST00000489895 RTL8CO15255 209 aa11.58□□□□□ -0.56
NISCH-213ENST00000489895 H0Y9P7 68 aa11.58□□□□□ -0.56
NISCH-213ENST00000489895 DEFB116Q30KQ4 102 aa11.57□□□□□ -0.56
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZRX8 168 aa11.57□□□□□ -0.56
NISCH-213ENST00000489895 F8P00451 2351 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-213ENST00000489895 TMEM254Q8TBM7 123 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-213ENST00000489895 CDIP1Q9H305 208 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZRP5 223 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-213ENST00000489895 C19orf73Q9NVV2 129 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-213ENST00000489895 hDV103S1A0JD37 113 aa11.53□□□□□ -0.56
NISCH-213ENST00000489895 BCE1O60756 84 aa11.53□□□□□ -0.56
NISCH-213ENST00000489895 MOBPQ13875 183 aa11.52□□□□□ -0.56
NISCH-213ENST00000489895 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.56
NISCH-213ENST00000489895 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
NISCH-213ENST00000489895 FAM218AQ96MZ4 157 aa11.52□□□□□ -0.57
NISCH-213ENST00000489895 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
NISCH-213ENST00000489895 PRO0461Q9UI25 63 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-213ENST00000489895 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-213ENST00000489895 FAM229AH3BQW9 127 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-213ENST00000489895 PCOTHQ58A44 107 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-213ENST00000489895 CRYGAP11844 174 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-213ENST00000489895 Q8NBF4 154 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-213ENST00000489895 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-213ENST00000489895 K7EIL1 84 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-213ENST00000489895 LITAFQ99732 161 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-213ENST00000489895 RETNLBQ9BQ08 111 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-213ENST00000489895 EPM2AB3EWF7 344 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP10-11P60412 298 aa11.47□□□□□ -0.57
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZQT0 140 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-213ENST00000489895 SPACA4Q8TDM5 124 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-213ENST00000489895 LINC00476Q8WZB0 136 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-213ENST00000489895 VPREB1P12018 145 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-213ENST00000489895 LINC00612Q8N6U2 182 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-213ENST00000489895 C1orf64Q8NEQ6 169 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-213ENST00000489895 A0A0U1RQV1 116 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-213ENST00000489895 IGLV6-57P01721 117 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP10-3P60369 221 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-213ENST00000489895 PRR34Q9NV39 138 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-213ENST00000489895 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-213ENST00000489895 SMIM29Q86T20 159 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-213ENST00000489895 TYMSOSQ8TAI1 123 aa11.4□□□□□ -0.59
NISCH-213ENST00000489895 CHTF8P0CG12 524 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-213ENST00000489895 H3BPC8 53 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-213ENST00000489895 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-213ENST00000489895 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-213ENST00000489895 IGKV2-30P06310 120 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-213ENST00000489895 KCNQ1DNQ9H478 68 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-213ENST00000489895 TM2D3Q9BRN9 247 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-213ENST00000489895 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
NISCH-213ENST00000489895 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-213ENST00000489895 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-213ENST00000489895 SPINK1P00995 79 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP1-1Q07627 177 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-213ENST00000489895 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-213ENST00000489895 LINC00313P59037 77 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-213ENST00000489895 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-213ENST00000489895 HECTD1Q9ULT8 2610 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-213ENST00000489895 FAM168BA1KXE4 195 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-213ENST00000489895 C15orf56Q8N910 161 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-213ENST00000489895 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
NISCH-213ENST00000489895 TLX1NBP0CAT3 122 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-213ENST00000489895 LINC00528Q8N1L1 170 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-213ENST00000489895 C7orf65Q6ZTY9 151 aa11.27□□□□□ -0.6
NISCH-213ENST00000489895 ACYP2P14621 99 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-213ENST00000489895 C8orf87E5RJ46 101 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-213ENST00000489895 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-213ENST00000489895 C1orf195Q5TG92 126 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-213ENST00000489895 TRAV22A0A0B4J277 110 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-213ENST00000489895 C9orf163Q8N9P6 203 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-213ENST00000489895 PSPHP1O15172 72 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-213ENST00000489895 A0A087WTM6 91 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-213ENST00000489895 DNAH12Q6ZR08 3092 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-213ENST00000489895 A8MWP4 228 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-213ENST00000489895 PMAIP1Q13794 54 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-213ENST00000489895 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-213ENST00000489895 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
NISCH-213ENST00000489895 ZNF861PO60384 105 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-213ENST00000489895 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
NISCH-213ENST00000489895 APLNQ9ULZ1 77 aa11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.3 ms