RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489639.1

MFSD1-217, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-217ENST00000489639 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.18□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.18□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 COL7A1Q02388 2944 aa4.17□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.17□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 A0A1B0GV90 55 aa4.17□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 USP17L23D6RBM5 183 aa4.17□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 C3orf84H3BNL1 204 aa4.17□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 CFC1BP0CG36 223 aa4.17□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 CFC1P0CG37 223 aa4.17□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 RNF151Q2KHN1 245 aa4.17□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 C14orf177Q52M58 125 aa4.17□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.17□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.17□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 C6orf223Q8N319 242 aa4.17□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.17□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 H3BUT2 72 aa4.16□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 PSCAO43653 123 aa4.16□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 NPC2P61916 151 aa4.16□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 SYCNQ0VAF6 134 aa4.16□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 C10orf25Q5T742 122 aa4.16□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.16□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.16□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.16□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.16□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.16□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.16□□□□□ -1.74
MFSD1-217ENST00000489639 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.15□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 A0A1W2PPM0 123 aa4.15□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 NDUFC2O95298 119 aa4.15□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 TSPAN13O95857 204 aa4.15□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 FABP2P12104 132 aa4.15□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 VAMP3Q15836 100 aa4.15□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 Q6ZRU5 148 aa4.15□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 CARD19Q96LW7 228 aa4.15□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.14□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.14□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 Q1RN00 199 aa4.14□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 CASC10Q5T4H9 136 aa4.14□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.14□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.14□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 HERC1Q15751 4861 aa4.13□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.13□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 PSMB2P49721 201 aa4.13□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 Q6ZR54 194 aa4.13□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 GAGE10A6NGK3 116 aa4.12□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 H7C2G1 150 aa4.12□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 K7EP34 96 aa4.12□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 LECT2O14960 151 aa4.12□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 COX6CP09669 75 aa4.12□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.12□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 SPCS1Q9Y6A9 102 aa4.12□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.11□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.11□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.11□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.11□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 M0R2N4 97 aa4.11□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 LY6G6CO95867 125 aa4.11□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 IGKV2D-28P01615 120 aa4.11□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 UBE2V1Q13404 147 aa4.11□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.11□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.11□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.1□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 TRIAP1O43715 76 aa4.1□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.1□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 WFDC2Q14508 124 aa4.1□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 GAGE2EQ4V326 116 aa4.1□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.1□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.1□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.1□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 TMEM126AQ9H061 195 aa4.1□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.1□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.1□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.1□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 M0R378 163 aa4.09□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 NCR3O14931 201 aa4.09□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 VPREB1P12018 145 aa4.09□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.09□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 Q6ZRP5 223 aa4.09□□□□□ -1.75
MFSD1-217ENST00000489639 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.08□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 ATXN8Q156A1 80 aa4.08□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 Q8N814 137 aa4.08□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.08□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 TENM2Q9NT68 2774 aa4.08□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 A0A087WTM6 91 aa4.07□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 C16orf90A8MZG2 172 aa4.07□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 H0YGX0 51 aa4.07□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 IGLV6-57P01721 117 aa4.07□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 GAGE2BQ13066 116 aa4.07□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms