RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 Q8N3U1 123 aa11.25□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa11.25□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 OTOGQ6ZRI0 2925 aa11.25□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa11.25□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP1-1Q07627 177 aa11.25□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 TENM1Q9UKZ4 2725 aa11.24□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM26A0A096LP01 95 aa11.24□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa11.23□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa11.23□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZQY7 126 aa11.23□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 A0A087WZ39 114 aa11.22□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 LRCOL1A6NCL2 159 aa11.22□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZVQ6 151 aa11.22□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 TM2D3Q9BRN9 247 aa11.22□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa11.22□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 Q8N9L7 120 aa11.22□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 J3QKU1 62 aa11.21□□□□□ -0.62
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00482Q8N8I6 264 aa11.21□□□□□ -0.62
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA3Q8NHX4 192 aa11.2□□□□□ -0.62
CCSAP-204ENST00000483092 LYPD5Q6UWN5 251 aa11.19□□□□□ -0.62
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV1-51P01701 117 aa11.18□□□□□ -0.62
CCSAP-204ENST00000483092 GYPEP15421 78 aa11.18□□□□□ -0.62
CCSAP-204ENST00000483092 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CCSAP-204ENST00000483092 ANGP03950 147 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CCSAP-204ENST00000483092 MIFP14174 115 aa11.17□□□□□ -0.62
CCSAP-204ENST00000483092 C16orf74Q96GX8 76 aa11.17□□□□□ -0.62
CCSAP-204ENST00000483092 PLAC8L1A1L4L8 177 aa11.16□□□□□ -0.62
CCSAP-204ENST00000483092 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CCSAP-204ENST00000483092 F8P00451 2351 aa11.16□□□□□ -0.62
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP10-3P60369 221 aa11.16□□□□□ -0.62
CCSAP-204ENST00000483092 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf195Q5TG92 126 aa11.15□□□□□ -0.62
CCSAP-204ENST00000483092 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa11.15□□□□□ -0.62
CCSAP-204ENST00000483092 C19orf73Q9NVV2 129 aa11.15□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZQT0 140 aa11.14□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 XAGE1AQ9HD64 81 aa11.14□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 IL17DQ8TAD2 202 aa11.14□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa11.13□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 INAFM1C9JVW0 142 aa11.13□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 NREPQ16612 68 aa11.13□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 HTN3P15516 51 aa11.12□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 LY6G6DO95868 133 aa11.12□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00575Q6W349 94 aa11.12□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 V9GYY9 64 aa11.12□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa11.11□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa11.11□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB135Q30KP9 77 aa11.11□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa11.11□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 HIVEP1P15822 2718 aa11.11□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 C6orf223Q8N319 242 aa11.11□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.11□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 BPY2O14599 106 aa11.1□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM254Q8TBM7 123 aa11.1□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 KLKP1Q107X0 134 aa11.1□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.09□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 Q8IZM0 81 aa11.09□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 C16orf95Q9H693 158 aa11.09□□□□□ -0.63
CCSAP-204ENST00000483092 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
CCSAP-204ENST00000483092 C3orf84H3BNL1 204 aa11.08□□□□□ -0.64
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB105AQ8NG35 78 aa11.08□□□□□ -0.64
CCSAP-204ENST00000483092 CELA1Q9UNI1 258 aa11.08□□□□□ -0.64
CCSAP-204ENST00000483092 PRR4Q16378 134 aa11.07□□□□□ -0.64
CCSAP-204ENST00000483092 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.64
CCSAP-204ENST00000483092 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CCSAP-204ENST00000483092 MUC7Q8TAX7 377 aa11.07□□□□□ -0.64
CCSAP-204ENST00000483092 Q8NDZ9 215 aa11.05□□□□□ -0.64
CCSAP-204ENST00000483092 FAM229BQ4G0N7 80 aa11.05□□□□□ -0.64
CCSAP-204ENST00000483092 SPAG11BQ08648 103 aa11.05□□□□□ -0.64
CCSAP-204ENST00000483092 C10orf25Q5T742 122 aa11.05□□□□□ -0.64
CCSAP-204ENST00000483092 SEC61GP60059 68 aa11.03□□□□□ -0.64
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFC1O43677 76 aa11.02□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 DIRC1Q969H9 104 aa11.02□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 HIGD2AQ9BW72 106 aa11.02□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 REG3AQ06141 175 aa11.02□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00167Q96N53 147 aa11.01□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 FAM30AQ9NZY2 134 aa11□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 STAB1Q9NY15 2570 aa10.99□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 X6R8D5 127 aa10.99□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 PRYO14603 147 aa10.99□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 CD164L2Q6UWJ8 174 aa10.99□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 CYSRT1A8MQ03 144 aa10.98□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 PDE6GP18545 87 aa10.98□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 CXCL6P80162 114 aa10.98□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 PSPHP1O15172 72 aa10.98□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 COX7BP24311 80 aa10.98□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa10.97□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 KLK12Q9UKR0 248 aa10.97□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 ESRGQ1W209 222 aa10.96□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 MAST4O15021 2626 aa10.96□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 NOTCH1P46531 2555 aa10.96□□□□□ -0.65
CCSAP-204ENST00000483092 PRO0255Q9UI72 69 aa10.96□□□□□ -0.66
CCSAP-204ENST00000483092 HIGD2BQ4VC39 106 aa10.95□□□□□ -0.66
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.5 ms