RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FREM2Q5SZK8 3169 aa11.61□□□□□ -0.55
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DSPP15924 2871 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ESRGQ1W209 222 aa11.47□□□□□ -0.57
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa11.45□□□□□ -0.58
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa11.42□□□□□ -0.58
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC01556Q5JQF7 62 aa11.42□□□□□ -0.58
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STAB1Q9NY15 2570 aa11.42□□□□□ -0.58
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C6orf48Q9UBA6 75 aa11.42□□□□□ -0.58
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa11.38□□□□□ -0.59
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa11.37□□□□□ -0.59
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa11.36□□□□□ -0.59
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf134Q5TEV5 83 aa11.26□□□□□ -0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MDFIQ99750 246 aa11.25□□□□□ -0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.25□□□□□ -0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H0Y9P7 68 aa11.24□□□□□ -0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UNC79Q9P2D8 2635 aa11.24□□□□□ -0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa11.22□□□□□ -0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HCG22E2RYF7 251 aa11.22□□□□□ -0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 hDV103S1A0JD37 113 aa11.22□□□□□ -0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.22□□□□□ -0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMIM29Q86T20 159 aa11.21□□□□□ -0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa11.21□□□□□ -0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRYGAP11844 174 aa11.21□□□□□ -0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CXCL6P80162 114 aa11.21□□□□□ -0.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa11.2□□□□□ -0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COL6A3P12111 3177 aa11.2□□□□□ -0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TACC2O95359 2948 aa11.2□□□□□ -0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00588Q9Y4M8 146 aa11.2□□□□□ -0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAH14Q0VDD8 3507 aa11.2□□□□□ -0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LIMD2Q9BT23 127 aa11.19□□□□□ -0.62
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