RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475302.1

ITGA6-210, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA6, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-210ENST00000475302 NPC2P61916 151 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 UBE2V1Q13404 147 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 CFAP161Q6P656 301 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 C2orf48Q96LS8 159 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 B5MCH6 92 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 PFN2P35080 140 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 MUC7Q8TAX7 377 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 K7EP34 96 aa6.33□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 Q8NDZ9 215 aa6.33□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 COPS9Q8WXC6 57 aa6.33□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 Q9HAA7 133 aa6.33□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 FBN3Q75N90 2809 aa6.33□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.32□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 VAMP3Q15836 100 aa6.32□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.32□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 Q6ZRU5 148 aa6.32□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 RMI2Q96E14 147 aa6.32□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.32□□□□□ -1.4
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ITGA6-210ENST00000475302 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.31□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.31□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.31□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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ITGA6-210ENST00000475302 USP17L23D6RBM5 183 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.29□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 GAGE10A6NGK3 116 aa6.29□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 WFDC2Q14508 124 aa6.29□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.29□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.28□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 TRIAP1O43715 76 aa6.28□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.28□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 SYCNQ0VAF6 134 aa6.28□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 Q6ZR54 194 aa6.28□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 PRO0461Q9UI25 63 aa6.28□□□□□ -1.4
ITGA6-210ENST00000475302 TCL1BO95988 128 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGA6-210ENST00000475302 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
ITGA6-210ENST00000475302 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGA6-210ENST00000475302 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.26□□□□□ -1.41
ITGA6-210ENST00000475302 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.26□□□□□ -1.41
ITGA6-210ENST00000475302 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.26□□□□□ -1.41
ITGA6-210ENST00000475302 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.26□□□□□ -1.41
ITGA6-210ENST00000475302 H7C2G1 150 aa6.26□□□□□ -1.41
ITGA6-210ENST00000475302 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
ITGA6-210ENST00000475302 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.26□□□□□ -1.41
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ITGA6-210ENST00000475302 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.24□□□□□ -1.41
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ITGA6-210ENST00000475302 IGLV6-57P01721 117 aa6.23□□□□□ -1.41
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ITGA6-210ENST00000475302 M0QXV9 152 aa6.19□□□□□ -1.42
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ITGA6-210ENST00000475302 M0R2N4 97 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGA6-210ENST00000475302 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
ITGA6-210ENST00000475302 C14orf177Q52M58 125 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGA6-210ENST00000475302 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGA6-210ENST00000475302 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGA6-210ENST00000475302 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGA6-210ENST00000475302 A0A087WTM6 91 aa6.17□□□□□ -1.42
ITGA6-210ENST00000475302 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.17□□□□□ -1.42
ITGA6-210ENST00000475302 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.17□□□□□ -1.42
ITGA6-210ENST00000475302 H0YGX0 51 aa6.17□□□□□ -1.42
ITGA6-210ENST00000475302 M0R378 163 aa6.17□□□□□ -1.42
ITGA6-210ENST00000475302 PSCAO43653 123 aa6.17□□□□□ -1.42
ITGA6-210ENST00000475302 TRACP01848 142 aa6.17□□□□□ -1.42
ITGA6-210ENST00000475302 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.17□□□□□ -1.42
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