RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465846.6

HOXB-AS3-203, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 434 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SNAPINO95295 136 aa10.77□□□□□ -0.69
HOXB-AS3-203ENST00000465846 VPREB1P12018 145 aa10.77□□□□□ -0.69
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NDUFA5Q16718 116 aa10.77□□□□□ -0.69
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TMEM170BQ5T4T1 132 aa10.77□□□□□ -0.69
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SVBPQ8N300 66 aa10.77□□□□□ -0.69
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa10.77□□□□□ -0.69
HOXB-AS3-203ENST00000465846 COX17Q14061 63 aa10.76□□□□□ -0.69
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HOXB-AS3-203ENST00000465846 TYMSOSQ8TAI1 123 aa10.74□□□□□ -0.69
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HOXB-AS3-203ENST00000465846 ANAPC11Q9NYG5 84 aa10.73□□□□□ -0.69
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
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HOXB-AS3-203ENST00000465846 CBLN2Q8IUK8 224 aa10.63□□□□□ -0.71
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HOXB-AS3-203ENST00000465846 LINC00304Q8N9R0 145 aa10.62□□□□□ -0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MUC17Q685J3 4493 aa10.61□□□□□ -0.71
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HOXB-AS3-203ENST00000465846 ATP6V1G1O75348 118 aa10.59□□□□□ -0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HERV-K104P63124 156 aa10.59□□□□□ -0.71
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HOXB-AS3-203ENST00000465846 SERF1AO75920 110 aa10.54□□□□□ -0.72
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LEPROTL1O95214 131 aa10.54□□□□□ -0.72
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TSPEAR-AS2P59090 65 aa10.54□□□□□ -0.72
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPRR4Q96PI1 79 aa10.54□□□□□ -0.72
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPRR1AP35321 89 aa10.52□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CTAG1AP78358 180 aa10.52□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LINC00337Q8N6G1 96 aa10.52□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa10.52□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KCNQ1DNQ9H478 68 aa10.52□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LEPROTO15243 131 aa10.51□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PLNP26678 52 aa10.51□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa10.5□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ANKRD39Q53RE8 183 aa10.5□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAT4Q6V0I7 4981 aa10.49□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa10.49□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DAND5Q8N907 189 aa10.49□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HSPB8Q9UJY1 196 aa10.49□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 J3QQQ9 107 aa10.47□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DPM2O94777 84 aa10.47□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FABP4P15090 132 aa10.47□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HERVK_113P61574 105 aa10.47□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TPRXLQ17RH7 258 aa10.47□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.46□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa10.46□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ARL17AQ8IVW1 177 aa10.46□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SMCR5Q8TEV8 140 aa10.46□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PMCHL2Q9BQD1 86 aa10.46□□□□□ -0.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IGKCP01834 107 aa10.45□□□□□ -0.74
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.45□□□□□ -0.74
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NMUP48645 174 aa10.44□□□□□ -0.74
HOXB-AS3-203ENST00000465846 S100A12P80511 92 aa10.44□□□□□ -0.74
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PPDPFQ9H3Y8 114 aa10.44□□□□□ -0.74
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa10.43□□□□□ -0.74
HOXB-AS3-203ENST00000465846 A0A0U1RQV1 116 aa10.43□□□□□ -0.74
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DDTP30046 118 aa10.43□□□□□ -0.74
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa10.43□□□□□ -0.74
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CDIP1Q9H305 208 aa10.43□□□□□ -0.74
HOXB-AS3-203ENST00000465846 COLCA2A8K830 154 aa10.42□□□□□ -0.74
HOXB-AS3-203ENST00000465846 B5MCH6 92 aa10.42□□□□□ -0.74
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