RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COX17Q14061 63 aa8.97□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.97□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NAT8Q9UHE5 227 aa8.97□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.96□□□□□ -0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERG28Q9UKR5 140 aa8.96□□□□□ -0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALKAL2Q6UX46 152 aa8.95□□□□□ -0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.93□□□□□ -0.98
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 CST9LQ9H4G1 147 aa8.88□□□□□ -0.99
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.87□□□□□ -0.99
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 SFTA2Q6UW10 78 aa8.87□□□□□ -0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.86□□□□□ -0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADCYAP1P18509 176 aa8.85□□□□□ -0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PMVKQ15126 192 aa8.85□□□□□ -0.99
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.8□□□□□ -1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 B5MCH6 92 aa8.79□□□□□ -1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERC2-IT1O76042 136 aa8.79□□□□□ -1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGLC3P0DOY3 106 aa8.79□□□□□ -1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PEA15Q15121 130 aa8.78□□□□□ -1
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.77□□□□□ -1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.75□□□□□ -1.01
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A0U1RRA0 63 aa8.73□□□□□ -1.01
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC01546A6NGU7 62 aa8.72□□□□□ -1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.71□□□□□ -1.02
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.7□□□□□ -1.02
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.69□□□□□ -1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.69□□□□□ -1.02
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.68□□□□□ -1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.68□□□□□ -1.02
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 C5orf52A6NGY3 159 aa8.66□□□□□ -1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDTP30046 118 aa8.66□□□□□ -1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.66□□□□□ -1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.65□□□□□ -1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.65□□□□□ -1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.65□□□□□ -1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C11orf86A6NJI1 115 aa8.64□□□□□ -1.03
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.63□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD164Q04900 197 aa8.62□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HERV-K104P63124 156 aa8.61□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.61□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q5XG85 94 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BAGE3Q86Y29 109 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00846Q9NV44 126 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPRR1BP22528 89 aa8.58□□□□□ -1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.58□□□□□ -1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.57□□□□□ -1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C1orf195Q5TG92 126 aa8.57□□□□□ -1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.56□□□□□ -1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM223A0PJW6 202 aa8.56□□□□□ -1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.56□□□□□ -1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.55□□□□□ -1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCE2BO14633 110 aa8.55□□□□□ -1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A096LNJ9 63 aa8.54□□□□□ -1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H7C2G1 150 aa8.54□□□□□ -1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRO1933Q9H354 126 aa8.54□□□□□ -1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C20orf202A1L168 122 aa8.53□□□□□ -1.04
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