RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368916.1

GABPB2-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GABPB2, Length 1,680 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB2-201ENST00000368916 LELP1Q5T871 98 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 LINC01006Q8NI28 216 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 PRR34Q9NV39 138 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 WDFY4Q6ZS81 3184 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 COL6A6A6NMZ7 2263 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 NCOR1O75376 2440 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa4.98□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 MP68P56378 58 aa4.98□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.98□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.98□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 TTC28Q96AY4 2481 aa4.97□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 ACACAQ13085 2346 aa4.97□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 NDUFS5O43920 106 aa4.97□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 UBE2AP49459 152 aa4.97□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 HCG22E2RYF7 251 aa4.96□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 DEFB130BP0DP73 79 aa4.96□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 DEFB130AP0DP74 79 aa4.96□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 VPREB1P12018 145 aa4.96□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 Q6ZRP5 223 aa4.96□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 SCXQ7RTU7 201 aa4.96□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 SPRR4Q96PI1 79 aa4.96□□□□□ -1.61
GABPB2-201ENST00000368916 LOC400499M0QZD8 3231 aa4.96□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.96□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 Q8NDZ9 215 aa4.96□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 Q9BRP9 147 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 PSCAO43653 123 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 SMIM29Q86T20 159 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa4.93□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 C10orf25Q5T742 122 aa4.93□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 Q8NBF4 154 aa4.93□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.93□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 ABCA2Q9BZC7 2435 aa4.93□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa4.93□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.92□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.92□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 SORL1Q92673 2214 aa4.92□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 H3BNG1 76 aa4.92□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 APOC4P55056 127 aa4.92□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 B9D2Q9BPU9 175 aa4.92□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.92□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.91□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 C1orf137Q5JT78 98 aa4.91□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 TACC2O95359 2948 aa4.91□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 BDP1A6H8Y1 2624 aa4.91□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 SYCNQ0VAF6 134 aa4.9□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 Q8N377 158 aa4.9□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.9□□□□□ -1.62
GABPB2-201ENST00000368916 ZFHX4Q86UP3 3567 aa4.9□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 C3orf84H3BNL1 204 aa4.89□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.89□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 SPART-AS1P0CW21 52 aa4.89□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 Q8N9L7 120 aa4.89□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.89□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 KLK12Q9UKR0 248 aa4.89□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 DMDP11532 3685 aa4.89□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.89□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.89□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 Q6ZRX8 168 aa4.89□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 LINC00208Q96KT6 92 aa4.89□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 MUC3AQ02505 3323 aa4.88□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 Q75L30 129 aa4.88□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 PSPHP1O15172 72 aa4.87□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 SPRR1AP35321 89 aa4.87□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 DSCR10P59022 87 aa4.87□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 A0A1W2PNM2 257 aa4.86□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa4.86□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 Q5VV11 94 aa4.86□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.86□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 A0A096LPF7 62 aa4.86□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.86□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 DEFB113Q30KQ7 82 aa4.86□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 CSMD1Q96PZ7 3565 aa4.85□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 BSNQ9UPA5 3926 aa4.85□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 A8MUN3 132 aa4.84□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 K7EQZ3 153 aa4.84□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 WFDC10AQ9H1F0 79 aa4.84□□□□□ -1.63
GABPB2-201ENST00000368916 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms