RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364877.1

RNU6-534P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 534, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-534P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-534P-201ENST00000364877 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 ATRQ13535 2644 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 UQCRHLA0A096LP55 91 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 LINC00032P0C843 101 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 ETDBQ3ZM63 59 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 DPY30Q9C005 99 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 HIGD1BQ9P298 99 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 FAM135AQ9P2D6 1515 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 TENM2Q9NT68 2774 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 CHD8Q9HCK8 2581 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 CCL22O00626 93 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 ACANP16112 2415 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 LAMA5O15230 3695 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 MON2Q7Z3U7 1717 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 M0R143 59 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 HMGN3Q15651 99 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 ALKAL2Q6UX46 152 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 ACBD7Q8N6N7 88 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 SPTA1P02549 2419 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 CUX1P39880 1505 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 H0YGG7 62 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 CLIP1P30622 1438 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 PCNX1Q96RV3 2341 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 NDUFA3O95167 84 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 COX7BP24311 80 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 SPRR2AP35326 72 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 NMSQ5H8A3 153 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 SAMD9Q5K651 1589 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 KIF20BQ96Q89 1820 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 C5P01031 1676 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 SHPRHQ149N8 1683 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 IQCF6A8MYZ5 107 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 GAFA1Q96PS6 74 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 C20orf78Q9BR46 151 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 ABCC2Q92887 1545 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 UBR3Q6ZT12 1888 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 LYSTQ99698 3801 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 SPRR2EP22531 72 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 PEA15Q15121 130 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 SNHG12Q9BXW3 62 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 TEX14Q8IWB6 1497 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 PDZD2O15018 2839 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 FYCO1Q9BQS8 1478 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 SMIM11AP58511 58 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 PKHD1P08F94 4074 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 MYH4Q9Y623 1939 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 RGPD2P0DJD1 1756 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 BCORQ6W2J9 1755 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 A0A1B0GUT8 65 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 PLGLAQ15195 96 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 WFDC9Q8NEX5 89 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 MAGI2Q86UL8 1455 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 H3BNG1 76 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 GYPAP02724 150 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 PKIAP61925 76 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-534P-201ENST00000364877 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-0.47□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 CYB5AP00167 134 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 Q9H521 79 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 LRRC7Q96NW7 1537 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 CUBNO60494 3623 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 S100A8P05109 93 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 DEFA5Q01523 94 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 ATP10BO94823 1461 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 HERC1Q15751 4861 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-0.5□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.1 ms