RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359957.7

BRMS1-201, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BRMS1, Length 1,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-201ENST00000359957 SYCNQ0VAF6 134 aa9.39□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.39□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.39□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.39□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 A4D1N5 150 aa9.39□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 SPAG11BQ08648 103 aa9.39□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 Q8IZM0 81 aa9.39□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 CFC1BP0CG36 223 aa9.38□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 CFC1P0CG37 223 aa9.38□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 IFITM1P13164 125 aa9.38□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 VAMP3Q15836 100 aa9.38□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.38□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 C2orf48Q96LS8 159 aa9.38□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 PRSS2P07478 247 aa9.37□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.37□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 DAND5Q8N907 189 aa9.37□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.37□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.37□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 A0A1W2PPM0 123 aa9.36□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 F8WDY8 70 aa9.36□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 KIAA0087Q14695 138 aa9.36□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 SFTA2Q6UW10 78 aa9.36□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 A0A0B4J2C4 111 aa9.35□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.35□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 NPC2P61916 151 aa9.35□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.35□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.35□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 A0A0U1RRA0 63 aa9.34□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 UBE2V1Q13404 147 aa9.34□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.34□□□□□ -0.91
BRMS1-201ENST00000359957 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.33□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 TSPAN13O95857 204 aa9.33□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 CHTF8P0CG12 524 aa9.33□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 Q6ZRU5 148 aa9.33□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.33□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.33□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.33□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 CXCL5P42830 114 aa9.32□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 C2orf82Q6UX34 121 aa9.32□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 PANO1I0J062 215 aa9.31□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 K7EP34 96 aa9.31□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.31□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 FABP2P12104 132 aa9.31□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 ERG28Q9UKR5 140 aa9.31□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.31□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 A0A087WYN8 130 aa9.31□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 A0A096LNI7 61 aa9.31□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 CKS1BP61024 79 aa9.31□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 RNF151Q2KHN1 245 aa9.31□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.31□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 COPS9Q8WXC6 57 aa9.31□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 PCLOQ9Y6V0 5065 aa9.3□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 LINC00158P58513 81 aa9.3□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 GAGE2BQ13066 116 aa9.3□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 SPCS1Q9Y6A9 102 aa9.3□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 GAGE10A6NGK3 116 aa9.29□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 C7orf33Q8WU49 177 aa9.29□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 PFN2P35080 140 aa9.28□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa9.28□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.28□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
BRMS1-201ENST00000359957 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.27□□□□□ -0.93
BRMS1-201ENST00000359957 FAT1Q14517 4588 aa9.27□□□□□ -0.93
BRMS1-201ENST00000359957 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.26□□□□□ -0.93
BRMS1-201ENST00000359957 ABCA13Q86UQ4 5058 aa9.26□□□□□ -0.93
BRMS1-201ENST00000359957 C10orf25Q5T742 122 aa9.25□□□□□ -0.93
BRMS1-201ENST00000359957 H7C2G1 150 aa9.24□□□□□ -0.93
BRMS1-201ENST00000359957 COX17Q14061 63 aa9.24□□□□□ -0.93
BRMS1-201ENST00000359957 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.24□□□□□ -0.93
BRMS1-201ENST00000359957 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.23□□□□□ -0.93
BRMS1-201ENST00000359957 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
BRMS1-201ENST00000359957 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
BRMS1-201ENST00000359957 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.23□□□□□ -0.93
BRMS1-201ENST00000359957 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.22□□□□□ -0.93
BRMS1-201ENST00000359957 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.22□□□□□ -0.93
BRMS1-201ENST00000359957 Q1RN00 199 aa9.22□□□□□ -0.93
BRMS1-201ENST00000359957 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.22□□□□□ -0.93
BRMS1-201ENST00000359957 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.21□□□□□ -0.94
BRMS1-201ENST00000359957 PSMB2P49721 201 aa9.21□□□□□ -0.94
BRMS1-201ENST00000359957 GAGE2EQ4V326 116 aa9.21□□□□□ -0.94
BRMS1-201ENST00000359957 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.21□□□□□ -0.94
BRMS1-201ENST00000359957 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.2□□□□□ -0.94
BRMS1-201ENST00000359957 TRIAP1O43715 76 aa9.2□□□□□ -0.94
BRMS1-201ENST00000359957 IGKV2D-28P01615 120 aa9.2□□□□□ -0.94
BRMS1-201ENST00000359957 Q6ZRP5 223 aa9.2□□□□□ -0.94
BRMS1-201ENST00000359957 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.18□□□□□ -0.94
BRMS1-201ENST00000359957 H3BMG7 143 aa9.18□□□□□ -0.94
BRMS1-201ENST00000359957 TCL1BO95988 128 aa9.18□□□□□ -0.94
BRMS1-201ENST00000359957 SCGB1C2P0DMR2 95 aa9.18□□□□□ -0.94
BRMS1-201ENST00000359957 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.18□□□□□ -0.94
BRMS1-201ENST00000359957 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa9.16□□□□□ -0.94
BRMS1-201ENST00000359957 A0A1W2PNN7 141 aa9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.3 ms