RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 C6orf223Q8N319 242 aa10.2□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC01356Q8N9X3 169 aa10.19□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 ITPR3Q14573 2671 aa10.19□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 C3orf84H3BNL1 204 aa10.19□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 NREPQ16612 68 aa10.19□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 V9GYY9 64 aa10.19□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 CELA1Q9UNI1 258 aa10.18□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa10.18□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q6ZQT0 140 aa10.18□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa10.18□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 BPY2O14599 106 aa10.17□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC00575Q6W349 94 aa10.16□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM254Q8TBM7 123 aa10.16□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 C16orf74Q96GX8 76 aa10.15□□□□□ -0.78
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CCNDBP1-201ENST00000300213 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP10.14□□□□□ -0.79
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa10.14□□□□□ -0.79
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATRQ13535 2644 aa10.13□□□□□ -0.79
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPAG11BQ08648 103 aa10.13□□□□□ -0.79
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q8IZM0 81 aa10.13□□□□□ -0.79
CCNDBP1-201ENST00000300213 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CCNDBP1-201ENST00000300213 C10orf25Q5T742 122 aa10.13□□□□□ -0.79
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa10.12□□□□□ -0.79
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CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM229BQ4G0N7 80 aa10.12□□□□□ -0.79
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CCNDBP1-201ENST00000300213 KLKP1Q107X0 134 aa10.11□□□□□ -0.79
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q8NDZ9 215 aa10.11□□□□□ -0.79
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CCNDBP1-201ENST00000300213 HIGD2AQ9BW72 106 aa10.11□□□□□ -0.79
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM30AQ9NZY2 134 aa10.11□□□□□ -0.79
CCNDBP1-201ENST00000300213 SEC61GP60059 68 aa10.1□□□□□ -0.79
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CCNDBP1-201ENST00000300213 ITPR2Q14571 2701 aa10.1□□□□□ -0.79
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PSPHP1O15172 72 aa10.09□□□□□ -0.79
CCNDBP1-201ENST00000300213 UNC79Q9P2D8 2635 aa10.09□□□□□ -0.79
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q6YL49 198 aa10.09□□□□□ -0.79
CCNDBP1-201ENST00000300213 KLK12Q9UKR0 248 aa10.09□□□□□ -0.79
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CCNDBP1-201ENST00000300213 HIGD2BQ4VC39 106 aa10.07□□□□□ -0.8
CCNDBP1-201ENST00000300213 NDUFC1O43677 76 aa10.06□□□□□ -0.8
CCNDBP1-201ENST00000300213 COX7BP24311 80 aa10.06□□□□□ -0.8
CCNDBP1-201ENST00000300213 CD164L2Q6UWJ8 174 aa10.05□□□□□ -0.8
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRYO14603 147 aa10.05□□□□□ -0.8
CCNDBP1-201ENST00000300213 C16orf95Q9H693 158 aa10.03□□□□□ -0.8
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PRO0255Q9UI72 69 aa10.02□□□□□ -0.81
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLAC8L1A1L4L8 177 aa10.01□□□□□ -0.81
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CCNDBP1-201ENST00000300213 IL17DQ8TAD2 202 aa10.01□□□□□ -0.81
CCNDBP1-201ENST00000300213 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa10□□□□□ -0.81
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIAA0087Q14695 138 aa10□□□□□ -0.81
CCNDBP1-201ENST00000300213 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa9.99□□□□□ -0.81
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa9.99□□□□□ -0.81
CCNDBP1-201ENST00000300213 COX17Q14061 63 aa9.99□□□□□ -0.81
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAST4O15021 2626 aa9.99□□□□□ -0.81
CCNDBP1-201ENST00000300213 DEFB135Q30KP9 77 aa9.98□□□□□ -0.81
CCNDBP1-201ENST00000300213 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.98□□□□□ -0.81
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP10-9P60411 292 aa9.97□□□□□ -0.81
CCNDBP1-201ENST00000300213 SMIM29Q86T20 159 aa9.96□□□□□ -0.81
CCNDBP1-201ENST00000300213 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa9.96□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-201ENST00000300213 DSCR9P59020 149 aa9.96□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PDZD2O15018 2839 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-201ENST00000300213 DEFB116Q30KQ4 102 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-201ENST00000300213 F8WDY8 70 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A1B0GUV1 79 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-201ENST00000300213 HIVEP1P15822 2718 aa9.93□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-201ENST00000300213 BAHCC1Q9P281 2608 aa9.91□□□□□ -0.82
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa9.91□□□□□ -0.82
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV6-57P01721 117 aa9.89□□□□□ -0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKV4-1P06312 121 aa9.89□□□□□ -0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 PMAIP1Q13794 54 aa9.89□□□□□ -0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 EPM2AB3EWF7 344 aa9.89□□□□□ -0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.89□□□□□ -0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.88□□□□□ -0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.87□□□□□ -0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 WFDC13Q8IUB5 93 aa9.87□□□□□ -0.83
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